Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

ZNF556

zinc finger protein 556

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
19p13.3
Koordináták
19. kromoszóma: 2 867 335–2 883 445 (GRCh38)
Exonok
4 exon, összesen 16,1 kb
Fehérje
456 aminosav
Más néven ismert
FLJ11637
MANE Select transzkriptum
ENST00000307635.3NM_024967.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ZNF556 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A ZNF556 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
19. kromoszóma, a ZNF556 helyét zárójel jelöli. A ZNF556 és környékén 23 gén a 19. kromoszómán, 2 375 390–3 375 389 között.19. kromoszóma19p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.432,4 Mb2,6 Mb2,8 Mb3 Mb3,2 MbTMPRSS9: 2 360 238–2 426 261, előre szálTMPRSS9TIMM13: 2 425 624–2 427 593, fordított szálTIMM13LMNB2: 2 427 638–2 456 992, fordított szálLMNB2GADD45B: 2 476 122–2 478 805, előre szálGADD45BGNG7: 2 511 214–2 702 727, fordított szálGNG7DIRAS1: 2 714 566–2 721 438, fordított szálDIRAS1: 2 717 769–2 740 048, fordított szálSLC39A3: 2 732 204–2 740 071, fordított szálSLC39A3SGTA: 2 754 711–2 783 390, fordított szálSGTATHOP1: 2 785 444–2 815 807, előre szálTHOP1ZNF554: 2 819 853–2 836 735, előre szálZNF554ZNF555: 2 841 437–2 860 471, előre szálZNF555ZNF556: 2 867 335–2 883 445, előre szálZNF556ZNF57: 2 900 914–2 919 102, előre szálZNF57ZNF77: 2 931 137–2 944 971, fordított szálZNF77TLE6: 2 977 538–2 995 179, előre szálTLE6TLE2: 2 997 632–3 047 635, fordított szálTLE2TLE5: 3 052 908–3 063 112, fordított szálTLE5GNA11: 3 094 320–3 124 001, előre szálGNA11GNA15: 3 136 027–3 163 749, előre szálGNA15S1PR4: 3 172 346–3 180 332, előre szálS1PR4NCLN: 3 185 563–3 209 575, előre szálNCLNCELF5: 3 224 636–3 297 076, előre szálCELF5NFIC: 3 314 403–3 469 217, előre szálNFICA ZNF556 ábrája: 4 exon a(z) 19. kromoszóma előre szálán1. exon: 2 867 335–2 867 424, 90 bázis2. exon: 2 873 496–2 873 622, 127 bázis3. exon: 2 876 093–2 876 276, 184 bázis4. exon: 2 877 273–2 883 445, 6173 bázis12345′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 16,1 kb-jából 6,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1371 bázis kódolja a fehérjét.

ZNF556 szekvenálása

8Könnyű

Mennyire nehéz a ZNF556 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A ZNF556 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a ZNF556 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség3,9%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések9,1%
  • GC-tartalom9,6%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). ZNF556 gén: zinc finger protein 556. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/znf556

Vancouver

Dante Labs. ZNF556 gén: zinc finger protein 556 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/znf556

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet