Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

ZCCHC17

zinc finger CCHC-type containing 17

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
1p35.2
Koordináták
1. kromoszóma: 31 297 032–31 364 936 (GRCh38)
Exonok
8 exon, összesen 67,9 kb
Fehérje
241 aminosav
Más néven ismert
PS1D, HSPC251, pNO40
MANE Select transzkriptum
ENST00000344147.10NM_016505.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ZCCHC17 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A ZCCHC17 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
1. kromoszóma, a ZCCHC17 helyét zárójel jelöli. A ZCCHC17 és környékén 12 gén a 1. kromoszómán, 30 830 984–31 830 983 között.1. kromoszóma1p35.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4431 Mb31,2 Mb31,4 Mb31,6 Mb31,8 MbSDC3: 30 869 466–30 908 813, fordított szálSDC3PUM1: 30 931 505–31 065 991, fordított szálPUM1NKAIN1: 31 179 084–31 239 992, fordított szálNKAIN1SNRNP40: 31 259 042–31 296 823, fordított szálSNRNP40ZCCHC17: 31 297 032–31 364 936, előre szálZCCHC17FABP3: 31 359 583–31 376 850, fordított szálFABP3SERINC2: 31 409 565–31 434 680, előre szálSERINC2TINAGL1: 31 576 357–31 587 691, előre szálTINAGL1HCRTR1: 31 617 660–31 632 518, előre szálHCRTR1PEF1: 31 629 862–31 644 910, fordított szálPEF1COL16A1: 31 652 247–31 704 387, fordított szálCOL16A1ADGRB2: 31 727 117–31 764 893, fordított szálADGRB2SPOCD1: 31 790 421–31 816 022, fordított szálSPOCD1A ZCCHC17 ábrája: 8 exon a(z) 1. kromoszóma előre szálán1. exon: 31 297 032–31 297 075, 44 bázis2. exon: 31 310 044–31 310 164, 121 bázis3. exon: 31 319 109–31 319 166, 58 bázis4. exon: 31 337 175–31 337 275, 101 bázis5. exon: 31 338 957–31 339 048, 92 bázis6. exon: 31 346 640–31 346 740, 101 bázis7. exon: 31 348 829–31 348 974, 146 bázis8. exon: 31 364 032–31 364 936, 905 bázis123456785′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 67,9 kb-jából 1,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 726 bázis kódolja a fehérjét.

ZCCHC17 szekvenálása

4Könnyű

Mennyire nehéz a ZCCHC17 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A ZCCHC17 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a ZCCHC17 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség3,3%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések3,5%
  • GC-tartalom0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). ZCCHC17 gén: zinc finger CCHC-type containing 17. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/zcchc17

Vancouver

Dante Labs. ZCCHC17 gén: zinc finger CCHC-type containing 17 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/zcchc17

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet