Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

STT3B

STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
3p23
Koordináták
3. kromoszóma: 31 532 925–31 637 616 (GRCh38)
Exonok
16 exon, összesen 104,7 kb
Fehérje
826 aminosav
Más néven ismert
SIMP, FLJ90106, STT3-B
MANE Select transzkriptum
ENST00000295770.4NM_178862.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) STT3B gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A STT3B felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
3. kromoszóma, a STT3B helyét zárójel jelöli. A STT3B és környékén 2 gén a 3. kromoszómán, 31 085 271–32 085 270 között.3. kromoszóma3p23p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2931,2 Mb31,4 Mb31,6 Mb31,8 Mb32 MbSTT3B: 31 532 925–31 637 616, előre szálSTT3BOSBPL10: 31 646 306–32 077 580, fordított szálOSBPL10ZNF860: 31 981 722–31 994 074, előre szálZNF860A STT3B ábrája: 16 exon a(z) 3. kromoszóma előre szálán1. exon: 31 532 925–31 533 312, 388 bázis2. exon: 31 576 396–31 576 504, 109 bázis3. exon: 31 579 809–31 580 096, 288 bázis4. exon: 31 596 798–31 596 863, 66 bázis5. exon: 31 600 360–31 600 459, 100 bázis6. exon: 31 615 105–31 615 203, 99 bázis7. exon: 31 616 929–31 617 075, 147 bázis8. exon: 31 617 940–31 617 988, 49 bázis9. exon: 31 619 676–31 619 830, 155 bázis10. exon: 31 622 097–31 622 308, 212 bázis11. exon: 31 623 674–31 623 861, 188 bázis12. exon: 31 624 914–31 625 085, 172 bázis13. exon: 31 625 954–31 626 127, 174 bázis14. exon: 31 629 298–31 629 411, 114 bázis15. exon: 31 632 935–31 633 147, 213 bázis16. exon: 31 635 984–31 637 616, 1633 bázis12468101214165′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 104,7 kb-jából 4,1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2481 bázis kódolja a fehérjét.

STT3B szekvenálása

3Könnyű

Mennyire nehéz a STT3B szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A STT3B exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a STT3B exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések3,9%
  • GC-tartalom11%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

A(z) STT3B génhez kapcsolódó tulajdonságok

Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) STT3B gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
  • Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). STT3B gén: STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/stt3b

Vancouver

Dante Labs. STT3B gén: STT3 oligosaccharyltransferase complex catalytic subunit B [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/stt3b

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet