Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

SNX7

sorting nexin 7

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
1p21.3
Koordináták
1. kromoszóma: 98 661 721–98 760 500 (GRCh38)
Exonok
9 exon, összesen 98,8 kb
Fehérje
451 aminosav
MANE Select transzkriptum
ENST00000306121.8NM_015976.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) SNX7 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A SNX7 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
1. kromoszóma, a SNX7 helyét zárójel jelöli. A SNX7 és környékén 1 gén a 1. kromoszómán, 98 211 111–99 211 110 között.1. kromoszóma1p21.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4498,4 Mb98,6 Mb98,8 Mb99 Mb99,2 MbSNX7: 98 661 721–98 760 500, előre szálSNX7PLPPR5: 98 890 245–99 227 929, fordított szálPLPPR5A SNX7 ábrája: 9 exon a(z) 1. kromoszóma előre szálán1. exon: 98 661 721–98 661 911, 191 bázis2. exon: 98 684 885–98 685 067, 183 bázis3. exon: 98 691 075–98 691 185, 111 bázis4. exon: 98 691 535–98 691 699, 165 bázis5. exon: 98 695 518–98 695 716, 199 bázis6. exon: 98 698 706–98 698 905, 200 bázis7. exon: 98 701 817–98 701 903, 87 bázis8. exon: 98 738 237–98 738 389, 153 bázis9. exon: 98 760 054–98 760 500, 447 bázis1246895′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 98,8 kb-jából 1,7 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1356 bázis kódolja a fehérjét.

SNX7 szekvenálása

2Könnyű

Mennyire nehéz a SNX7 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A SNX7 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a SNX7 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések5,7%
  • GC-tartalom11%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). SNX7 gén: sorting nexin 7. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/snx7

Vancouver

Dante Labs. SNX7 gén: sorting nexin 7 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/snx7

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet