Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

PRR16

proline rich 16

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
5q23.1
Koordináták
5. kromoszóma: 120 464 300–120 687 314 (GRCh38)
Exonok
2 exon, összesen 223 kb
Fehérje
304 aminosav
Más néven ismert
DSC54
MANE Select transzkriptum
ENST00000407149.7NM_001300783.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) PRR16 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A PRR16 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
5. kromoszóma, a PRR16 helyét zárójel jelöli. A PRR16 és környékén 0 gén a 5. kromoszómán, 120 075 807–121 075 806 között.5. kromoszóma5q23.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3120,2 Mb120,4 Mb120,6 Mb120,8 Mb121 MbPRR16: 120 464 300–120 687 314, előre szálPRR16A PRR16 ábrája: 2 exon a(z) 5. kromoszóma előre szálán1. exon: 120 464 300–120 464 645, 346 bázis2. exon: 120 685 954–120 687 314, 1361 bázis125′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 223 kb-jából 1,7 kb-ot tesznek ki; ezek közül 915 bázis kódolja a fehérjét.

PRR16 szekvenálása

6Könnyű

Mennyire nehéz a PRR16 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A PRR16 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a PRR16 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések5,8%
  • GC-tartalom23%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). PRR16 gén: proline rich 16. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/prr16

Vancouver

Dante Labs. PRR16 gén: proline rich 16 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/prr16

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet