Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

NFAT5

nuclear factor of activated T cells 5

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
16q22.1
Koordináták
16. kromoszóma: 69 565 966–69 704 654 (GRCh38)
Exonok
15 exon, összesen 138,7 kb
Fehérje
1549 aminosav
Más néven ismert
TONEBP, KIAA0827, NFATL1, OREBP, NFATZ, NF-AT5
MANE Select transzkriptum
ENST00000349945.7NM_138713.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) NFAT5 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A NFAT5 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
16. kromoszóma, a NFAT5 helyét zárójel jelöli. A NFAT5 és környékén 18 gén a 16. kromoszómán, 69 135 310–70 135 309 között.16. kromoszóma16q22.1p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.369,2 Mb69,4 Mb69,6 Mb69,8 Mb70 MbUTP4: 69 131 291–69 231 130, előre szálUTP4SNTB2: 69 187 140–69 309 052, előre szálSNTB2: 69 299 682–69 322 700, előre szálVPS4A: 69 311 299–69 326 939, előre szálCOG8: 69 320 140–69 339 920, fordított szálPDF: 69 321 991–69 330 613, fordított szál: 69 328 644–69 334 871, fordított szál: 69 335 091–69 356 306, fordított szál: 69 335 276–69 351 730, fordított szálNIP7: 69 337 996–69 343 107, előre szálTMED6: 69 343 018–69 351 811, fordított szálTMED6TERF2: 69 355 464–69 408 571, fordított szálTERF2CYB5B: 69 398 402–69 480 778, előre szálCYB5BNFAT5: 69 565 966–69 704 654, előre szálNFAT5NQO1: 69 691 310–69 726 668, fordított szálNQO1NOB1: 69 741 871–69 754 943, fordított szálNOB1WWP2: 69 762 281–69 944 553, előre szálWWP2CLEC18A: 69 950 705–69 964 452, előre szálCLEC18APDPR: 70 114 225–70 162 537, előre szálPDPRA NFAT5 ábrája: 15 exon a(z) 16. kromoszóma előre szálán1. exon: 69 565 966–69 566 374, 409 bázis2. exon: 69 568 495–69 568 548, 54 bázis3. exon: 69 626 403–69 626 528, 126 bázis4. exon: 69 647 028–69 647 586, 559 bázis5. exon: 69 653 236–69 653 428, 193 bázis6. exon: 69 655 609–69 655 799, 191 bázis7. exon: 69 659 727–69 659 899, 173 bázis8. exon: 69 669 977–69 670 111, 135 bázis9. exon: 69 670 236–69 670 288, 53 bázis10. exon: 69 677 203–69 677 335, 133 bázis11. exon: 69 684 887–69 684 970, 84 bázis12. exon: 69 690 940–69 691 088, 149 bázis13. exon: 69 691 749–69 694 239, 2491 bázis14. exon: 69 695 136–69 695 379, 244 bázis15. exon: 69 696 360–69 704 654, 8295 bázis12468101214155′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 138,7 kb-jából 13,3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 4650 bázis kódolja a fehérjét.

NFAT5 szekvenálása

3Könnyű

Mennyire nehéz a NFAT5 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A NFAT5 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a NFAT5 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések6,8%
  • GC-tartalom5,8%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). NFAT5 gén: nuclear factor of activated T cells 5. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/nfat5

Vancouver

Dante Labs. NFAT5 gén: nuclear factor of activated T cells 5 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/nfat5

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet