Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

HS3ST3B1

heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
17p12
Koordináták
17. kromoszóma: 14 301 081–14 349 404 (GRCh38)
Exonok
2 exon, összesen 48,3 kb
Fehérje
390 aminosav
Más néven ismert
3OST3B1, 30ST3B1
MANE Select transzkriptum
ENST00000360954.3NM_006041.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) HS3ST3B1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A HS3ST3B1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
17. kromoszóma, a HS3ST3B1 helyét zárójel jelöli. A HS3ST3B1 és környékén 2 gén a 17. kromoszómán, 13 825 243–14 825 242 között.17. kromoszóma17p12p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.314 Mb14,2 Mb14,4 Mb14,6 Mb14,8 MbCOX10: 14 069 490–14 231 736, előre szálCOX10CDRT15: 14 235 673–14 236 862, fordított szálCDRT15HS3ST3B1: 14 301 081–14 349 404, előre szálHS3ST3B1A HS3ST3B1 ábrája: 2 exon a(z) 17. kromoszóma előre szálán1. exon: 14 301 081–14 302 072, 992 bázis2. exon: 14 345 028–14 349 404, 4377 bázis125′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 48,3 kb-jából 5,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1173 bázis kódolja a fehérjét.

HS3ST3B1 szekvenálása

14Könnyű

Mennyire nehéz a HS3ST3B1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A HS3ST3B1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a HS3ST3B1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség9,7%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések3,7%
  • GC-tartalom18%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). HS3ST3B1 gén: heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/hs3st3b1

Vancouver

Dante Labs. HS3ST3B1 gén: heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/hs3st3b1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet