Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

HOXB8

homeobox B8

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
17q21.32
Koordináták
17. kromoszóma: 48 612 346–48 615 292 (GRCh38)
Exonok
2 exon, összesen 2,9 kb
Fehérje
243 aminosav
Korábbi jelölések
HOX2, HOX2D
MANE Select transzkriptum
ENST00000239144.5NM_024016.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) HOXB8 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A HOXB8 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
17. kromoszóma, a HOXB8 helyét zárójel jelöli. A HOXB8 és környékén 20 gén a 17. kromoszómán, 48 113 819–49 113 818 között.17. kromoszóma17q21.32p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.348,2 Mb48,4 Mb48,6 Mb48,8 Mb49 MbSNX11: 48 103 357–48 128 226, előre szálSNX11SKAP1: 48 133 433–48 430 275, fordított szálSKAP1HOXB1: 48 528 526–48 531 011, fordított szálHOXB1HOXB2: 48 540 894–48 545 115, fordított szálHOXB2HOXB3: 48 548 870–48 604 912, fordított szálHOXB4: 48 575 507–48 578 429, fordított szálHOXB5: 48 591 257–48 594 179, fordított szálHOXB6: 48 595 525–48 605 011, fordított szálHOXB6HOXB7: 48 607 222–48 633 572, fordított szálHOXB7HOXB8: 48 612 346–48 615 292, fordított szálHOXB8HOXB9: 48 621 156–48 626 576, fordított szálHOXB9PRAC2: 48 720 813–48 724 767, előre szálPRAC2PRAC1: 48 721 719–48 723 082, fordított szálPRAC1HOXB13: 48 724 750–48 729 076, fordított szálHOXB13TTLL6: 48 762 234–48 817 229, fordított szálTTLL6CALCOCO2: 48 830 971–48 872 910, előre szálCALCOCO2ATP5MC1: 48 892 765–48 895 875, előre szálATP5MC1UBE2Z: 48 908 368–48 929 062, előre szálUBE2ZSNF8: 48 928 972–48 944 842, fordított szálSNF8GIP: 48 958 554–48 968 596, fordított szálGIPIGF2BP1: 48 997 225–49 056 148, előre szálIGF2BP1A HOXB8 ábrája: 2 exon a(z) 17. kromoszóma fordított szálán2. exon: 48 612 346–48 613 509, 1164 bázis1. exon: 48 614 281–48 615 292, 1012 bázis215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 2,9 kb-jából 2,2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 732 bázis kódolja a fehérjét.

HOXB8 szekvenálása

13Könnyű

Mennyire nehéz a HOXB8 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A HOXB8 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a HOXB8 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések21%
  • GC-tartalom35%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). HOXB8 gén: homeobox B8. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/hoxb8

Vancouver

Dante Labs. HOXB8 gén: homeobox B8 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/hoxb8

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet