Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

CXCL8

C-X-C motif chemokine ligand 8

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
4q13.3
Koordináták
4. kromoszóma: 73 740 569–73 743 716 (GRCh38)
Exonok
4 exon, összesen 3,1 kb
Fehérje
99 aminosav
Más néven ismert
SCYB8, LUCT, LECT, MDNCF, TSG-1, IL-8, NAP-1, 3-10C, MONAP, AMCF-I, LYNAP, NAF, b-ENAP, GCP-1, K60, GCP1, NAP1
Korábbi jelölések
IL8
MANE Select transzkriptum
ENST00000307407.8NM_000584.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) CXCL8 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A CXCL8 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
4. kromoszóma, a CXCL8 helyét zárójel jelöli. A CXCL8 és környékén 15 gén a 4. kromoszómán, 73 242 143–74 242 142 között.4. kromoszóma4q13.3p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.273,4 Mb73,6 Mb73,8 Mb74 Mb74,2 MbANKRD17: 73 073 376–73 259 169, fordított szálANKRD17ALB: 73 397 114–73 426 607, előre szálALBAFP: 73 431 138–73 456 174, előre szálAFPAFM: 73 481 659–73 504 173, előre szálAFMRASSF6: 73 571 550–73 620 631, fordított szálRASSF6CXCL8: 73 740 569–73 743 716, előre szálCXCL8CXCL6: 73 836 622–73 849 064, előre szálCXCL6PF4V1: 73 853 292–73 854 483, előre szálPF4V1CXCL1: 73 868 963–73 871 388, előre szálCXCL1PF4: 73 980 759–73 982 111, fordított szálPF4: 73 981 074–73 988 190, fordított szálPPBP: 73 985 966–73 988 276, fordított szálPPBPCXCL5: 73 995 642–73 998 687, fordított szálCXCL5CXCL3: 74 036 589–74 038 807, fordított szálCXCL3CXCL2: 74 096 842–74 099 196, fordított szálCXCL2MTHFD2L: 74 114 174–74 303 099, előre szálMTHFD2LA CXCL8 ábrája: 4 exon a(z) 4. kromoszóma előre szálán1. exon: 73 740 569–73 740 722, 154 bázis2. exon: 73 741 542–73 741 677, 136 bázis3. exon: 73 741 949–73 742 032, 84 bázis4. exon: 73 742 449–73 743 716, 1268 bázis12345′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 3,1 kb-jából 1,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 300 bázis kódolja a fehérjét.

CXCL8 szekvenálása

13Könnyű

Mennyire nehéz a CXCL8 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A CXCL8 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a CXCL8 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések8,7%
  • GC-tartalom54%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). CXCL8 gén: C-X-C motif chemokine ligand 8. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/cxcl8

Vancouver

Dante Labs. CXCL8 gén: C-X-C motif chemokine ligand 8 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/cxcl8

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet