Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

CLECL1

C-type lectin like 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
12p13.31
Koordináták
12. kromoszóma: 9 722 492–9 733 097 (GRCh38)
Exonok
2 exon, összesen 10,6 kb
Fehérje
89 aminosav
Más néven ismert
DCAL1
Korábbi jelölések
CLECL1P
MANE Select transzkriptum
ENST00000973278.1NM_001441815.1
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) CLECL1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A CLECL1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
12. kromoszóma, a CLECL1 helyét zárójel jelöli. A CLECL1 és környékén 17 gén a 12. kromoszómán, 9 227 795–10 227 794 között.12. kromoszóma12p13.31p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.339,4 Mb9,6 Mb9,8 Mb10 Mb10,2 MbKLRB1: 9 593 888–9 607 949, fordított szálKLRB1CLEC2D: 9 664 969–9 699 553, előre szálCLEC2DCLECL1: 9 722 492–9 733 097, fordított szálCLECL1CD69: 9 752 486–9 760 901, fordított szálCD69KLRF1: 9 827 420–9 845 007, előre szálKLRF1CLEC2B: 9 852 369–9 870 635, fordított szálCLEC2BKLRF2: 9 881 489–9 895 833, előre szálKLRF2CLEC2A: 9 898 673–9 932 370, fordított szálCLEC2ACLEC12A: 9 951 261–9 996 102, előre szálCLEC12ACLEC1B: 9 985 642–10 013 424, fordított szálCLEC1BCLEC12B: 10 010 627–10 018 802, előre szálCLEC12BCLEC9A: 10 030 678–10 066 031, előre szálCLEC9ACLEC1A: 10 064 397–10 115 555, fordított szálCLEC1ACLEC7A: 10 116 766–10 130 269, fordított szálCLEC7AOLR1: 10 156 240–10 172 143, fordított szálOLR1TMEM52B: 10 170 512–10 191 807, előre szálTMEM52BGABARAPL1: 10 212 458–10 223 132, előre szálGABARAPL1KLRD1: 10 226 058–10 329 608, előre szálKLRD1A CLECL1 ábrája: 2 exon a(z) 12. kromoszóma fordított szálán2. exon: 9 722 492–9 722 813, 322 bázis1. exon: 9 732 949–9 733 097, 149 bázis215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 10,6 kb-jából 0,5 kb-ot tesznek ki; ezek közül 270 bázis kódolja a fehérjét.

CLECL1 szekvenálása

0Könnyű

Mennyire nehéz a CLECL1 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-as skálán

A CLECL1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen található, ahol a rövid olvasatok tisztán illeszthetők.

Ehhez hozzájárul: a CLECL1 exonjainak aránya az egyes nehéz régiótípusokban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések0%
  • GC-tartalom0%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle nehezen szekvenálható régiókat bemutató térképeire épül.Hogyan számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). CLECL1 gén: C-type lectin like 1. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/clecl1

Vancouver

Dante Labs. CLECL1 gén: C-type lectin like 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/clecl1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet