Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

ATP1B3

ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 3

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
3q23
Koordináták
3. kromoszóma: 141 876 643–141 926 549 (GRCh38)
Exonok
7 exon, összesen 49,9 kb
Fehérje
279 aminosav, 31,5 kDa
Más néven ismert
FLJ29027, CD298
MANE Select transzkriptum
ENST00000286371.8NM_001679.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ATP1B3 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A ATP1B3 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
3. kromoszóma, a ATP1B3 helyét zárójel jelöli. A ATP1B3 és környékén 8 gén a 3. kromoszómán, 141 401 596–142 401 595 között.3. kromoszóma3q23p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29141,6 Mb141,8 Mb142 Mb142,2 Mb142,4 MbZBTB38: 141 324 154–141 449 792, előre szálZBTB38RASA2: 141 486 967–141 615 362, előre szálRASA2RNF7: 141 738 189–141 747 611, előre szálRNF7: 141 738 474–141 807 919, előre szálGRK7: 141 763 408–141 819 352, előre szálGRK7ATP1B3: 141 876 643–141 926 549, előre szálATP1B3TFDP2: 141 944 428–142 149 598, fordított szálTFDP2GK5: 142 157 527–142 225 620, fordított szálGK5XRN1: 142 306 607–142 448 087, fordított szálXRN1A ATP1B3 ábrája: 7 exon a(z) 3. kromoszóma előre szálán1. exon: 141 876 643–141 876 910, 268 bázis2. exon: 141 903 620–141 903 748, 129 bázis3. exon: 141 907 167–141 907 274, 108 bázis4. exon: 141 913 652–141 913 836, 185 bázis5. exon: 141 915 970–141 916 020, 51 bázis6. exon: 141 921 977–141 922 063, 87 bázis7. exon: 141 925 531–141 926 549, 1019 bázis12345675′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 49,9 kb-jából 1,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 840 bázis kódolja a fehérjét.

ATP1B3 szekvenálása

8Könnyű

Mennyire nehéz a ATP1B3 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A ATP1B3 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a ATP1B3 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség3,7%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések3,6%
  • GC-tartalom15%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). ATP1B3 gén: ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 3. Lekérve: 2026. október 21., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/atp1b3

Vancouver

Dante Labs. ATP1B3 gén: ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 3 [Internet]. [idézve: 2026. október 21.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/atp1b3

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet