Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

ARHGEF33

Rho guanine nucleotide exchange factor 33

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
2p22.1
Koordináták
2. kromoszóma: 38 889 875–38 975 454 (GRCh38)
Exonok
18 exon, összesen 85,6 kb
Fehérje
870 aminosav
MANE Select transzkriptum
ENST00000409978.7NM_001145451.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ARHGEF33 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A ARHGEF33 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
2. kromoszóma, a ARHGEF33 helyét zárójel jelöli. A ARHGEF33 és környékén 10 gén a 2. kromoszómán, 38 432 665–39 432 664 között.2. kromoszóma2p22.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.338,6 Mb38,8 Mb39 Mb39,2 Mb39,4 MbHNRNPLL: 38 561 891–38 603 586, fordított szálHNRNPLLGALM: 38 665 906–38 766 049, előre szálGALMSRSF7: 38 743 599–38 751 498, fordított szálSRSF7GEMIN6: 38 751 534–38 785 002, előre szálGEMIN6DHX57: 38 797 724–38 875 943, fordított szálDHX57MORN2: 38 875 969–38 882 709, előre szálMORN2: 38 875 991–38 929 071, előre szálARHGEF33: 38 889 875–38 975 454, előre szálARHGEF33SOS1: 38 962 206–39 124 345, fordított szálSOS1CDKL4: 39 167 972–39 243 983, fordított szálCDKL4MAP4K3: 39 249 266–39 437 354, fordított szálMAP4K3A ARHGEF33 ábrája: 18 exon a(z) 2. kromoszóma előre szálán1. exon: 38 889 875–38 889 986, 112 bázis2. exon: 38 895 777–38 895 849, 73 bázis3. exon: 38 919 363–38 919 472, 110 bázis4. exon: 38 921 374–38 921 423, 50 bázis5. exon: 38 928 907–38 929 071, 165 bázis6. exon: 38 929 709–38 929 830, 122 bázis7. exon: 38 931 109–38 931 251, 143 bázis8. exon: 38 935 775–38 935 834, 60 bázis9. exon: 38 937 335–38 937 559, 225 bázis10. exon: 38 943 901–38 944 030, 130 bázis11. exon: 38 950 989–38 951 121, 133 bázis12. exon: 38 953 162–38 953 245, 84 bázis13. exon: 38 954 373–38 954 456, 84 bázis14. exon: 38 956 899–38 957 047, 149 bázis15. exon: 38 958 034–38 958 198, 165 bázis16. exon: 38 959 841–38 960 648, 808 bázis17. exon: 38 966 006–38 966 145, 140 bázis18. exon: 38 973 714–38 975 454, 1741 bázis1246810121416185′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 85,6 kb-jából 4,5 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2613 bázis kódolja a fehérjét.

ARHGEF33 szekvenálása

4Könnyű

Mennyire nehéz a ARHGEF33 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A ARHGEF33 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a ARHGEF33 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések1,5%
  • GC-tartalom18%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). ARHGEF33 gén: Rho guanine nucleotide exchange factor 33. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/arhgef33

Vancouver

Dante Labs. ARHGEF33 gén: Rho guanine nucleotide exchange factor 33 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/arhgef33

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet