Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

ANKK1

ankyrin repeat and kinase domain containing 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
11q23.2
Koordináták
11. kromoszóma: 113 387 779–113 400 416 (GRCh38)
Exonok
8 exon, összesen 12,6 kb
Fehérje
765 aminosav
Más néven ismert
X-kinase
MANE Select transzkriptum
ENST00000303941.4NM_178510.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ANKK1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A ANKK1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
11. kromoszóma, a ANKK1 helyét zárójel jelöli. A ANKK1 és környékén 7 gén a 11. kromoszómán, 112 894 098–113 894 097 között.11. kromoszóma11q23.2p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25113 Mb113,2 Mb113,4 Mb113,6 Mb113,8 MbNCAM1: 112 961 275–113 278 436, előre szálNCAM1TTC12: 113 314 543–113 383 544, előre szálTTC12ANKK1: 113 387 779–113 400 416, előre szálANKK1DRD2: 113 409 021–113 476 402, fordított szálDRD2TMPRSS5: 113 687 543–113 706 390, fordított szálTMPRSS5ZW10: 113 729 794–113 773 771, fordított szálZW10CLDN25: 113 779 796–113 780 485, előre szálCLDN25USP28: 113 797 870–113 875 615, fordított szálUSP28A ANKK1 ábrája: 8 exon a(z) 11. kromoszóma előre szálán1. exon: 113 387 779–113 388 069, 291 bázis2. exon: 113 393 481–113 393 775, 295 bázis3. exon: 113 394 929–113 395 080, 152 bázis4. exon: 113 395 359–113 395 408, 50 bázis5. exon: 113 396 067–113 396 222, 156 bázis6. exon: 113 397 224–113 397 342, 119 bázis7. exon: 113 397 980–113 398 016, 37 bázis8. exon: 113 398 964–113 400 416, 1453 bázis123456785′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 12,6 kb-jából 2,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2298 bázis kódolja a fehérjét.

ANKK1 szekvenálása

8Könnyű

Mennyire nehéz a ANKK1 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A ANKK1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a ANKK1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések0%
  • GC-tartalom38%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). ANKK1 gén: ankyrin repeat and kinase domain containing 1. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/ankk1

Vancouver

Dante Labs. ANKK1 gén: ankyrin repeat and kinase domain containing 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/ankk1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet