Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

AKAP17A

A-kinase anchoring protein 17A

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
Xp22.33 and Yp11.32
Koordináták
X. kromoszóma: 1 591 604–1 602 520 (GRCh38)
Exonok
5 exon, összesen 10,9 kb
Fehérje
695 aminosav
Más néven ismert
XE7, XE7Y, DXYS155E, MGC39904, 721P, CCDC133
Korábbi jelölések
CXYorf3, SFRS17A
MANE Select transzkriptum
ENST00000313871.9NM_005088.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) AKAP17A gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A AKAP17A felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
X. kromoszóma, a AKAP17A helyét zárójel jelöli. A AKAP17A és környékén 7 gén a X. kromoszómán, 1 097 062–2 097 061 között.X. kromoszómaXp22.33 and Yp11.32p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q281,2 Mb1,4 Mb1,6 Mb1,8 Mb2 MbCRLF2: 1 190 490–1 212 723, fordított szálCRLF2CSF2RA: 1 268 779–1 325 373, előre szálCSF2RAIL3RA: 1 335 025–1 382 689, előre szálIL3RASLC25A6: 1 350 030–1 392 929, fordított szálSLC25A6ASMTL: 1 403 126–1 453 786, fordított szálASMTLP2RY8: 1 462 572–1 537 207, fordított szálP2RY8AKAP17A: 1 591 604–1 602 520, előre szálAKAP17AASMT: 1 615 059–1 643 081, előre szálASMTA AKAP17A ábrája: 5 exon a(z) X. kromoszóma előre szálán1. exon: 1 591 604–1 591 769, 166 bázis2. exon: 1 593 444–1 594 224, 781 bázis3. exon: 1 595 384–1 595 532, 149 bázis4. exon: 1 599 192–1 599 432, 241 bázis5. exon: 1 600 659–1 602 520, 1862 bázis123455′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 10,9 kb-jából 3,2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2088 bázis kódolja a fehérjét.

AKAP17A szekvenálása

64Nehéz

Mennyire nehéz a AKAP17A szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A AKAP17A nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok kihagyhatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ami tovább nehezíti: a AKAP17A exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY100%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések6,8%
  • GC-tartalom46%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). AKAP17A gén: A-kinase anchoring protein 17A. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/akap17a

Vancouver

Dante Labs. AKAP17A gén: A-kinase anchoring protein 17A [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/akap17a

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet