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Gène

TRIM40

tripartite motif containing 40

Résumé

Localisation cytogénétique
6p22.1
Coordonnées
Chromosome 6 : 30 136 140–30 148 728 (GRCh38)
Exons
6 exons sur 12,6 kb
Protéine
258 acides aminés
Aussi appelé
RNF35
Transcrit MANE Select
ENST00000396581.6NM_001286633.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TRIM40. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TRIM40

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 6, avec un crochet à l'emplacement de TRIM40. TRIM40 et 22 gènes à proximité sur le chromosome 6, de 29 642 434 à 30 642 433.Chromosome 66p22.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2729,8 Mb30 Mb30,2 Mb30,4 Mb30,6 MbMOG : 29 656 598–29 674 431, brin directMOGZFP57 : 29 672 482–29 681 174, brin inverseZFP57HLA-F : 29 722 738–29 740 358, brin directHLA-FHLA-G : 29 826 967–29 831 130, brin directHLA-GHLA-A : 29 941 260–29 949 606, brin directHLA-APOLR1H : 30 058 899–30 064 909, brin directPOLR1HPPP1R11 : 30 066 709–30 074 025, brin directPPP1R11RNF39 : 30 070 266–30 075 849, brin inverseRNF39TRIM31 : 30 102 886–30 113 126, brin inverseTRIM31TRIM40 : 30 136 140–30 148 728, brin directTRIM40TRIM10 : 30 151 943–30 161 288, brin inverseTRIM10TRIM15 : 30 163 194–30 173 160, brin directTRIM15TRIM26 : 30 184 446–30 214 158, brin inverseTRIM26TRIM39 : 30 325 880–30 344 265, brin directTRIM39TRIM39-RPP21 : 30 328 907–30 346 854, brin directTRIM39-RPP21RPP21 : 30 345 125–30 346 884, brin directRPP21HLA-E : 30 489 495–30 494 205, brin directHLA-EGNL1 : 30 541 212–30 556 603, brin inverseGNL1PRR3 : 30 556 704–30 563 723, brin directPRR3ABCF1 : 30 571 383–30 597 179, brin directABCF1PPP1R10 : 30 600 400–30 618 612, brin inversePPP1R10MRPS18B : 30 617 759–30 626 398, brin directMRPS18BATAT1 : 30 626 837–30 646 835, brin directATAT1Schéma de TRIM40 : 6 exons sur le brin direct du chromosome 6Exon 1 : 30 136 140–30 136 189, 50 basesExon 2 : 30 136 733–30 137 381, 649 basesExon 3 : 30 145 994–30 146 089, 96 basesExon 4 : 30 146 985–30 147 209, 225 basesExon 5 : 30 147 520–30 147 542, 23 basesExon 6 : 30 147 725–30 148 728, 1 004 bases1234565′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2 kb sur les 12,6 kb du gène ; 777 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

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Dante Labs. (s.d.). Gène TRIM40 : tripartite motif containing 40. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/trim40

Vancouver

Dante Labs. Gène TRIM40 : tripartite motif containing 40 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/trim40

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