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Gène

SWT1

SWT1 RNA endoribonuclease homolog

Résumé

Localisation cytogénétique
1q25.3
Coordonnées
Chromosome 1 : 185 157 167–185 291 781 (GRCh38)
Exons
19 exons sur 134,6 kb
Protéine
900 acides aminés
Aussi appelé
FLJ20121, HsSwt1
Symboles précédents
C1orf26
Transcrit MANE Select
ENST00000367500.9NM_017673.7
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SWT1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SWT1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de SWT1. SWT1 et 5 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 184 724 474 à 185 724 473.Chromosome 11q25.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44184,8 Mb185 Mb185,2 Mb185,4 Mb185,6 MbEDEM3 : 184 690 237–184 754 907, brin inverseEDEM3NIBAN1 : 184 790 724–184 974 660, brin inverseNIBAN1RNF2 : 185 044 865–185 102 850, brin directRNF2TRMT1L : 185 118 085–185 157 072, brin inverseTRMT1LSWT1 : 185 157 167–185 291 781, brin directSWT1IVNS1ABP : 185 292 931–185 317 862, brin inverseIVNS1ABPSchéma de SWT1 : 19 exons sur le brin direct du chromosome 1Exon 1 : 185 157 167–185 157 314, 148 basesExon 2 : 185 160 833–185 160 925, 93 basesExon 3 : 185 166 572–185 166 652, 81 basesExon 4 : 185 168 340–185 168 398, 59 basesExon 5 : 185 174 372–185 175 113, 742 basesExon 6 : 185 180 391–185 180 450, 60 basesExon 7 : 185 181 946–185 182 057, 112 basesExon 8 : 185 184 243–185 184 344, 102 basesExon 9 : 185 184 743–185 184 931, 189 basesExon 10 : 185 190 549–185 190 642, 94 basesExon 11 : 185 202 654–185 202 799, 146 basesExon 12 : 185 204 700–185 204 863, 164 basesExon 13 : 185 206 625–185 206 763, 139 basesExon 14 : 185 214 507–185 214 655, 149 basesExon 15 : 185 221 849–185 222 036, 188 basesExon 16 : 185 231 577–185 231 708, 132 basesExon 17 : 185 271 323–185 271 389, 67 basesExon 18 : 185 276 604–185 276 668, 65 basesExon 19 : 185 290 674–185 291 781, 1 108 bases124681012141618195′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,8 kb sur les 134,6 kb du gène ; 2 703 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène SWT1 : SWT1 RNA endoribonuclease homolog. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/swt1

Vancouver

Dante Labs. Gène SWT1 : SWT1 RNA endoribonuclease homolog [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/swt1

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