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Gène

SPRR2D

small proline rich protein 2D

Résumé

Localisation cytogénétique
1q21.3
Coordonnées
Chromosome 1 : 153 039 732–153 041 120 (GRCh38)
Exons
2 exons sur 1,4 kb
Protéine
72 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000360379.4NM_006945.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

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Structure de SPRR2D

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de SPRR2D. SPRR2D et 44 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 152 540 426 à 153 540 425.Chromosome 11q21.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44152,6 Mb152,8 Mb153 Mb153,2 Mb153,4 MbLCE3E : 152 565 654–152 566 780, brin inverseLCE3ELCE3D : 152 579 381–152 580 516, brin inverseLCE3DLCE3C : 152 600 234–152 601 086, brin directLCE3CLCE3B : 152 613 811–152 614 098, brin directLCE3BLCE3A : 152 622 834–152 623 103, brin inverseLCE3ALCE2D : 152 658 824–152 664 659, brin directLCE2C : 152 675 279–152 676 569, brin directLCE2B : 152 686 123–152 687 397, brin directLCE2BLCE2A : 152 698 345–152 699 442, brin directLCE2ALCE4A : 152 708 160–152 709 434, brin directLCE4AKPLCE : 152 719 522–152 720 470, brin directKPLCEKPRP : 152 758 025–152 762 056, brin directKPRPLCE1F : 152 775 140–152 777 024, brin directLCE1E : 152 786 214–152 788 426, brin directLCE1ELCE1D : 152 796 721–152 798 181, brin directLCE1C : 152 804 832–152 806 651, brin inverseLCE1CLCE1B : 152 811 971–152 813 108, brin directLCE1BLCE1A : 152 827 473–152 828 097, brin directLCE1ALCE6A : 152 842 856–152 843 983, brin directLCE6ALCE7A : 152 859 996–152 861 252, brin directLCE7ASMCP : 152 870 060–152 885 047, brin directSMCPIVL : 152 908 539–152 911 886, brin directIVLSPRR5 : 152 947 206–152 949 255, brin directSPRR5SPRR4 : 152 970 648–152 972 574, brin directSPRR4SPRR1A : 152 984 081–152 985 814, brin directSPRR1ASPRR3 : 153 001 743–153 003 859, brin directSPRR3SPRR1B : 153 031 196–153 032 900, brin directSPRR1BSPRR2D : 153 039 732–153 041 120, brin inverseSPRR2DSPRR2A : 153 056 118–153 065 583, brin inverseSPRR2ASPRR2B : 153 070 216–153 087 834, brin inverseSPRR2BSPRR2E : 153 093 135–153 119 469, brin inverseSPRR2ESPRR2F : 153 112 119–153 122 899, brin inverseSPRR2FSPRR2G : 153 149 565–153 164 447, brin inverseSPRR2GLELP1 : 153 203 430–153 205 120, brin directLELP1PRR9 : 153 217 584–153 219 310, brin directPRR9LORICRIN : 153 259 687–153 262 124, brin directLORICRINPGLYRP3 : 153 297 116–153 312 952, brin inversePGLYRP3PGLYRP4 : 153 330 120–153 348 841, brin inversePGLYRP4S100A9 : 153 357 767–153 361 036, brin directS100A9S100A12 : 153 373 703–153 375 660, brin inverseS100A12S100A8 : 153 390 018–153 422 638, brin inverseS100A8S100A7A : 153 416 520–153 423 222, brin directS100A7AS100A7 : 153 457 742–153 460 653, brin inverseS100A7S100A6 : 153 532 726–153 536 549, brin inverseS100A6S100A5 : 153 537 147–153 543 074, brin inverseS100A5Schéma de SPRR2D : 2 exons sur le brin inverse du chromosome 1Exon 2 : 153 039 732–153 040 365, 634 basesExon 1 : 153 041 078–153 041 120, 43 bases215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 0,7 kb sur les 1,4 kb du gène ; 219 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène SPRR2D : small proline rich protein 2D. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/sprr2d

Vancouver

Dante Labs. Gène SPRR2D : small proline rich protein 2D [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/sprr2d

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