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Gène

RGS1

regulator of G protein signaling 1

Résumé

Localisation cytogénétique
1q31.2
Coordonnées
Chromosome 1 : 192 575 773–192 580 024 (GRCh38)
Exons
5 exons sur 4,3 kb
Protéine
209 acides aminés
Aussi appelé
1R20, IR20, BL34
Symboles précédents
IER1
Transcrit MANE Select
ENST00000367459.8NM_002922.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore RGS1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de RGS1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de RGS1. RGS1 et 6 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 192 077 899 à 193 077 898.Chromosome 11q31.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44192,2 Mb192,4 Mb192,6 Mb192,8 Mb193 MbRGS18 : 192 158 344–192 187 172, brin directRGS18RGS21 : 192 316 992–192 367 285, brin directRGS21RGS1 : 192 575 773–192 580 024, brin directRGS1RGS13 : 192 636 061–192 660 311, brin directRGS13RGS2 : 192 809 038–192 812 283, brin directRGS2UCHL5 : 193 012 245–193 060 080, brin inverseUCHL5RO60 : 193 059 422–193 091 777, brin directRO60Schéma de RGS1 : 5 exons sur le brin direct du chromosome 1Exon 1 : 192 575 773–192 575 929, 157 basesExon 2 : 192 576 285–192 576 365, 81 basesExon 3 : 192 576 774–192 576 835, 62 basesExon 4 : 192 578 222–192 578 385, 164 basesExon 5 : 192 579 137–192 580 024, 888 bases123455′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,4 kb sur les 4,3 kb du gène ; 630 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de RGS1

4Facile

Difficulté de séquençage de RGS1 avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de RGS1 se situent dans des zones où les lectures courtes se positionnent sans ambiguïté.

Facteur aggravant : la part des exons de RGS1 située dans chaque type de région difficile

  • Mappabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Partagé avec le chrY0 %
  • Couverture de la référence0 %
  • Répétitions5,1 %
  • Teneur en GC15 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes des régions difficiles à séquencer de Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène RGS1 : regulator of G protein signaling 1. Consulté le 19 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/rgs1

Vancouver

Dante Labs. Gène RGS1 : regulator of G protein signaling 1 [Internet]. [consulté le 19 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/rgs1

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