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Gène

PTPRK

protein tyrosine phosphatase receptor type K

Résumé

Localisation cytogénétique
6q22.33
Coordonnées
Chromosome 6 : 127 968 785–128 520 599 (GRCh38)
Exons
30 exons sur 551,8 kb
Protéine
1 440 acides aminés
Aussi appelé
R-PTP-kappa
Transcrit MANE Select
ENST00000368226.9NM_002844.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PTPRK. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PTPRK

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 6, avec un crochet à l'emplacement de PTPRK. PTPRK et 6 gènes à proximité sur le chromosome 6, de 127 416 970 à 129 072 414.Chromosome 66q22.33p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q27127,6 Mb127,8 Mb128 Mb128,2 Mb128,4 Mb128,6 Mb128,8 Mb129 Mb : 127 438 406–127 519 001, brin inverseKIAA0408 : 127 438 406–127 459 433, brin inverseKIAA0408MTCL3 : 127 467 569–127 519 383, brin inverseMTCL3C6orf58 : 127 519 455–127 591 820, brin directC6orf58THEMIS : 127 706 178–127 918 631, brin inverseTHEMISPTPRK : 127 968 785–128 520 599, brin inversePTPRKLAMA2 : 128 883 075–129 517 185, brin directLAMA2Schéma de PTPRK : 30 exons sur le brin inverse du chromosome 6Exon 30 : 127 968 785–127 970 280, 1 496 basesExon 29 : 127 973 022–127 973 157, 136 basesExon 28 : 127 973 664–127 973 827, 164 basesExon 27 : 127 976 657–127 976 782, 126 basesExon 26 : 127 976 923–127 977 054, 132 basesExon 25 : 127 981 116–127 981 289, 174 basesExon 24 : 127 982 831–127 982 980, 150 basesExon 23 : 127 983 242–127 983 377, 136 basesExon 22 : 127 985 721–127 985 875, 155 basesExon 21 : 127 990 769–127 990 885, 117 basesExon 20 : 127 991 294–127 991 391, 98 basesExon 19 : 127 992 673–127 992 709, 37 basesExon 18 : 127 995 462–127 995 538, 77 basesExon 17 : 127 996 901–127 996 988, 88 basesExon 16 : 127 998 720–127 998 904, 185 basesExon 15 : 128 005 084–128 005 244, 161 basesExon 14 : 128 009 130–128 009 268, 139 basesExon 13 : 128 064 758–128 064 794, 37 basesExon 12 : 128 067 519–128 067 792, 274 basesExon 11 : 128 078 813–128 078 918, 106 basesExon 10 : 128 082 437–128 082 638, 202 basesExon 9 : 128 083 715–128 083 824, 110 basesExon 8 : 128 089 690–128 089 992, 303 basesExon 7 : 128 184 432–128 184 725, 294 basesExon 6 : 128 218 922–128 219 096, 175 basesExon 5 : 128 240 035–128 240 150, 116 basesExon 4 : 128 242 521–128 242 602, 82 basesExon 3 : 128 322 039–128 322 310, 272 basesExon 2 : 128 397 566–128 397 688, 123 basesExon 1 : 128 520 259–128 520 599, 341 bases30201015′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 6 kb sur les 551,8 kb du gène ; 4 323 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène PTPRK : protein tyrosine phosphatase receptor type K. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ptprk

Vancouver

Dante Labs. Gène PTPRK : protein tyrosine phosphatase receptor type K [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ptprk

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