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Gène

OTOP1

otopetrin 1

Résumé

Localisation cytogénétique
4p16.3
Coordonnées
Chromosome 4 : 4 188 726–4 226 929 (GRCh38)
Exons
6 exons sur 38,2 kb
Protéine
612 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000296358.5NM_177998.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore OTOP1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de OTOP1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 4, avec un crochet à l'emplacement de OTOP1. OTOP1 et 6 gènes à proximité sur le chromosome 4, de 3 707 828 à 4 707 827.Chromosome 44p16.3p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.23,8 Mb4 Mb4,2 Mb4,4 Mb4,6 MbADRA2C : 3 766 348–3 768 526, brin directADRA2COTOP1 : 4 188 726–4 226 929, brin inverseOTOP1TMEM128 : 4 235 541–4 248 372, brin inverseTMEM128LYAR : 4 267 572–4 290 196, brin inverseLYARZBTB49 : 4 290 221–4 321 786, brin directZBTB49NSG1 : 4 348 140–4 479 327, brin directNSG1STX18 : 4 414 973–4 542 346, brin inverseSTX18Schéma de OTOP1 : 6 exons sur le brin inverse du chromosome 4Exon 6 : 4 188 726–4 188 973, 248 basesExon 5 : 4 197 166–4 198 103, 938 basesExon 4 : 4 202 448–4 202 578, 131 basesExon 3 : 4 206 072–4 206 130, 59 basesExon 2 : 4 212 868–4 213 004, 137 basesExon 1 : 4 226 462–4 226 929, 468 bases6543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2 kb sur les 38,2 kb du gène ; 1 839 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène OTOP1 : otopetrin 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/otop1

Vancouver

Dante Labs. Gène OTOP1 : otopetrin 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/otop1

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