Gène
OR1N2
olfactory receptor family 1 subfamily N member 2
- HGNC 15111↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000171501↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 138882↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 9q33.2
- Coordonnées
- Chromosome 9 : 122 553 112–122 554 214 (GRCh38)
- Exons
- 1 exon sur 1,1 kb
- Protéine
- 316 acides aminés
- Transcrit MANE Select
- ENST00000373688.3NM_001004457.2
- Type de locus
- Codant pour une protéine
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
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Aucun rapport Genome Test ne lit encore OR1N2. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.
Structure de OR1N2
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 1,1 kb sur les 1,1 kb du gène ; 951 de ces bases codent pour la protéine.
Séquençage de OR1N2
0Facile
Difficulté de séquençage de OR1N2 avec des lectures courtes, sur 100
0 · Facile100 · Difficile
Presque tous les exons de OR1N2 se trouvent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.
Ce qui s'y ajoute : la part des exons de OR1N2 dans chaque type de zone difficile
- MappabilitéPortions où des lectures de 100 ou 250 pb ne peuvent pas être placées de façon unique, un appel effectué à cet endroit pouvant donc être manquant ou erroné. Poids 35 %.0 %
- HomologieDuplications segmentaires : copies ailleurs dans le génome, comme les paralogues et les pseudogènes, à 90 % d'identité ou plus. Poids 30 %.0 %
- RépétitionsRépétitions en tandem et séquences d'une même base, sur lesquelles les lectures glissent et qu'elles risquent de ne pas couvrir entièrement. Poids 15 %.0 %
- Teneur en GCFenêtres contenant moins de 25 % ou plus de 65 % de G et de C, que la préparation de la bibliothèque couvre mal. Poids 10 %.0 %
- Couverture de référenceLacunes de l'assemblage de référence à proximité, où il n'existe aucune séquence sur laquelle les lectures peuvent s'aligner. Poids 10 %.0 %
Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du scoreChaque barre représente la part des bases exoniques de OR1N2 situées dans ce type de zone difficile. Un seul type peut suffire à rendre un gène difficile à analyser, et chaque type supplémentaire ajoute moins : 0 lorsqu'aucune base ne se trouve dans une zone de ce type, 100 lorsque chaque base se trouve dans une zone où les lectures ne peuvent pas être placées de façon unique.
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où proviennent ces données
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène OR1N2 : olfactory receptor family 1 subfamily N member 2. Consulté le 19 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/or1n2
Dante Labs. Gène OR1N2 : olfactory receptor family 1 subfamily N member 2 [Internet]. [consulté le 19 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/or1n2
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