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Gène

CCDC38

coiled-coil domain containing 38

Résumé

Localisation cytogénétique
12q23.1
Coordonnées
Chromosome 12 : 95 867 048–95 942 614 (GRCh38)
Exons
16 exons sur 75,6 kb
Protéine
563 acides aminés
Aussi appelé
FLJ40089
Transcrit MANE Select
ENST00000344280.8NM_182496.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore CCDC38. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de CCDC38

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 12, avec un crochet à l'emplacement de CCDC38. CCDC38 et 9 gènes à proximité sur le chromosome 12, de 95 404 831 à 96 404 830.Chromosome 1212q23.1p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3395,6 Mb95,8 Mb96 Mb96,2 Mb96,4 MbMETAP2 : 95 473 520–95 515 935, brin directMETAP2USP44 : 95 515 926–95 553 341, brin inverseUSP44NTN4 : 95 657 529–95 791 373, brin inverseNTN4SNRPF : 95 858 762–95 903 828, brin directSNRPFCCDC38 : 95 867 048–95 942 614, brin inverseCCDC38AMDHD1 : 95 943 046–95 968 830, brin directAMDHD1HAL : 95 972 662–95 996 365, brin inverseHALLTA4H : 96 000 298–96 043 523, brin inverseLTA4HELK3 : 96 193 978–96 269 835, brin directELK3CDK17 : 96 278 227–96 400 597, brin inverseCDK17Schéma de CCDC38 : 16 exons sur le brin inverse du chromosome 12Exon 16 : 95 867 048–95 867 189, 142 basesExon 15 : 95 869 480–95 869 573, 94 basesExon 14 : 95 872 255–95 872 460, 206 basesExon 13 : 95 878 211–95 878 346, 136 basesExon 12 : 95 879 644–95 879 795, 152 basesExon 11 : 95 881 485–95 881 554, 70 basesExon 10 : 95 888 458–95 888 506, 49 basesExon 9 : 95 890 832–95 890 930, 99 basesExon 8 : 95 894 989–95 895 146, 158 basesExon 7 : 95 898 385–95 898 465, 81 basesExon 6 : 95 898 568–95 898 731, 164 basesExon 5 : 95 906 387–95 906 451, 65 basesExon 4 : 95 917 129–95 917 294, 166 basesExon 3 : 95 918 876–95 918 976, 101 basesExon 2 : 95 936 473–95 936 523, 51 basesExon 1 : 95 942 431–95 942 614, 184 bases16141210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,9 kb sur les 75,6 kb du gène ; 1 692 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène CCDC38 : coiled-coil domain containing 38. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ccdc38

Vancouver

Dante Labs. Gène CCDC38 : coiled-coil domain containing 38 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ccdc38

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