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Gène

CCDC171

coiled-coil domain containing 171

Résumé

Localisation cytogénétique
9p22.3
Coordonnées
Chromosome 9 : 15 553 043–15 974 037 (GRCh38)
Exons
26 exons sur 421 kb
Protéine
1 326 acides aminés
Aussi appelé
FLJ39267, FLJ46740, Em:AL513423.1, bA778P13.1, bA536D16.1
Symboles précédents
C9orf93
Transcrit MANE Select
ENST00000380701.8NM_173550.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore CCDC171. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de CCDC171

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 9, avec un crochet à l'emplacement de CCDC171. CCDC171 et 3 gènes à proximité sur le chromosome 9, de 15 132 048 à 16 395 032.Chromosome 99p22.3p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.315,2 Mb15,4 Mb15,6 Mb15,8 Mb16 Mb16,2 MbTTC39B : 15 163 622–15 307 360, brin inverseTTC39BSNAPC3 : 15 422 661–15 465 953, brin directSNAPC3PSIP1 : 15 461 998–15 511 202, brin inversePSIP1CCDC171 : 15 553 043–15 974 037, brin directCCDC171Schéma de CCDC171 : 26 exons sur le brin direct du chromosome 9Exon 1 : 15 553 043–15 553 302, 260 basesExon 2 : 15 563 978–15 564 129, 152 basesExon 3 : 15 571 624–15 571 759, 136 basesExon 4 : 15 578 849–15 579 023, 175 basesExon 5 : 15 591 366–15 591 556, 191 basesExon 6 : 15 594 041–15 594 172, 132 basesExon 7 : 15 623 267–15 623 413, 147 basesExon 8 : 15 657 127–15 657 219, 93 basesExon 9 : 15 666 163–15 666 323, 161 basesExon 10 : 15 678 758–15 678 896, 139 basesExon 11 : 15 695 235–15 695 337, 103 basesExon 12 : 15 721 769–15 721 875, 107 basesExon 13 : 15 723 681–15 723 746, 66 basesExon 14 : 15 724 776–15 724 976, 201 basesExon 15 : 15 727 869–15 728 036, 168 basesExon 16 : 15 729 610–15 729 798, 189 basesExon 17 : 15 744 273–15 744 777, 505 basesExon 18 : 15 745 515–15 745 631, 117 basesExon 19 : 15 777 600–15 777 826, 227 basesExon 20 : 15 778 968–15 779 150, 183 basesExon 21 : 15 784 509–15 784 694, 186 basesExon 22 : 15 846 702–15 846 847, 146 basesExon 23 : 15 848 893–15 848 947, 55 basesExon 24 : 15 874 532–15 874 663, 132 basesExon 25 : 15 920 270–15 920 422, 153 basesExon 26 : 15 971 609–15 974 037, 2 429 bases1510152025265′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 6,6 kb sur les 421 kb du gène ; 3 981 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène CCDC171 : coiled-coil domain containing 171. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ccdc171

Vancouver

Dante Labs. Gène CCDC171 : coiled-coil domain containing 171 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ccdc171

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