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Gen

SUPT4H1

SPT4 homolog, DSIF elongation factor subunit

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
17q22
Koordinaten
Chromosom 17: 58.345.178–58.352.201 (GRCh38)
Exons
5 Exons über 7 kb
Protein
117 Aminosäuren
Auch bekannt als
SPT4H, Spt4, Supt4a
Frühere Symbole
SUPT4H
MANE-Select-Transkript
ENST00000225504.8NM_003168.3
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet SUPT4H1 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von SUPT4H1

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 17, mit einer Klammer, an der SUPT4H1 liegt. SUPT4H1 und 22 Gene in der Nähe auf Chromosom 17, von 57.848.690 bis 58.848.689.Chromosom 1717q22p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.358 Mb58,2 Mb58,4 Mb58,6 Mb58,8 MbMRPS23: 57.834.781–57.850.076, Minus-StrangMRPS23CUEDC1: 57.861.231–57.955.851, Minus-StrangCUEDC1VEZF1: 57.971.547–57.988.389, Minus-StrangVEZF1: 57.989.038–58.007.246, Minus-StrangSRSF1: 57.996.889–58.007.346, Minus-StrangSRSF1DYNLL2: 58.082.825–58.095.542, Plus-StrangDYNLL2OR4D1: 58.148.384–58.159.585, Plus-StrangOR4D1OR4D2: 58.166.982–58.171.411, Plus-StrangOR4D2EPX: 58.192.726–58.205.174, Plus-StrangEPXMKS1: 58.205.350–58.219.605, Minus-StrangMKS1LPO: 58.218.548–58.268.518, Plus-StrangLPOMPO: 58.269.855–58.280.935, Minus-StrangMPOTSPOAP1: 58.301.228–58.328.823, Minus-StrangTSPOAP1SUPT4H1: 58.345.178–58.352.201, Minus-StrangSUPT4H1: 58.345.206–58.417.595, Minus-StrangRNF43: 58.353.671–58.417.735, Minus-StrangRNF43HSF5: 58.420.167–58.488.408, Minus-StrangHSF5MTMR4: 58.489.529–58.517.905, Minus-StrangMTMR4SEPTIN4: 58.519.969–58.544.368, Minus-StrangSEPTIN4TEX14: 58.556.678–58.692.055, Minus-StrangTEX14IGBP1C: 58.660.424–58.692.055, Minus-StrangIGBP1CRAD51C: 58.692.569–58.735.611, Plus-StrangRAD51CPPM1E: 58.755.851–58.985.179, Plus-StrangPPM1EDiagramm von SUPT4H1: 5 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 17Exon 5: 58.345.178–58.346.313, 1.136 BasenExon 4: 58.347.188–58.347.241, 54 BasenExon 3: 58.347.529–58.347.584, 56 BasenExon 2: 58.351.402–58.351.508, 107 BasenExon 1: 58.352.067–58.352.201, 135 Basen543215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 1,5 kb der 7 kb des Gens aus; 354 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von SUPT4H1

45Schwer

Wie schwer sich SUPT4H1 mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Ein großer Teil von SUPT4H1 liegt in Bereichen, in denen Short Reads eine Veränderung übersehen oder falsch zuordnen können.

Dazu kommt der Anteil der Exons von SUPT4H1 in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability0 %
  • Homologie74 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenzabdeckung0 %
  • Wiederholungen1,1 %
  • GC-Gehalt0,1 %

Ein Dante-Labs-Score aus unserer eigenen Forschung, basierend auf den Karten schwer sequenzierbarer Regionen aus Genome in a Bottle des NIST.So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). SUPT4H1-Gen: SPT4 homolog, DSIF elongation factor subunit. Abgerufen am 19. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/supt4h1

Vancouver

Dante Labs. SUPT4H1-Gen: SPT4 homolog, DSIF elongation factor subunit [Internet]. [zitiert am 19. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/supt4h1

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