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Gen

PRAMEF14

PRAME family member 14

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
1p36.21
Koordinaten
Chromosom 1: 13.341.892–13.347.134 (GRCh38)
Exons
4 Exons über 5,2 kb
Protein
474 Aminosäuren
Auch bekannt als
OTTHUMG00000007916
MANE-Select-Transkript
ENST00000334600.7NM_001024661.2
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet PRAMEF14 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von PRAMEF14

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 1, mit einer Klammer, an der PRAMEF14 liegt. PRAMEF14 und 25 Gene in der Nähe auf Chromosom 1, von 12.844.513 bis 13.844.512.Chromosom 11p36.21p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4413 Mb13,2 Mb13,4 Mb13,6 Mb13,8 MbHNRNPCL1: 12.847.377–12.848.720, Minus-StrangPRAMEF2: 12.857.086–12.861.909, Plus-StrangPRAMEF2PRAMEF4: 12.879.212–12.886.201, Minus-StrangPRAMEF4PRAMEF10: 12.892.250–12.898.270, Minus-StrangPRAMEF10PRAMEF7: 12.916.610–12.920.751, Plus-StrangPRAMEF7PRAMEF6: 12.938.472–12.947.580, Minus-StrangPRAMEF6PRAMEF27: 13.049.476–13.056.575, Minus-StrangPRAMEF27HNRNPCL3: 13.060.769–13.062.878, Plus-StrangHNRNPCL3PRAMEF25: 13.068.677–13.077.884, Plus-StrangPRAMEF25HNRNPCL2: 13.115.488–13.116.854, Minus-StrangHNRNPCL2PRAMEF26: 13.148.905–13.158.116, Minus-StrangHNRNPCL4: 13.163.914–13.165.631, Minus-StrangHNRNPCL4PRAMEF9: 13.171.848–13.179.459, Plus-StrangPRAMEF9PRAMEF13: 13.196.188–13.201.409, Minus-StrangPRAMEF13PRAMEF18: 13.222.695–13.226.154, Minus-StrangPRAMEF18PRAMEF5: 13.254.198–13.263.435, Plus-StrangPRAMEF5PRAMEF8: 13.281.304–13.285.137, Minus-StrangPRAMEF8PRAMEF33: 13.303.539–13.308.907, Plus-StrangPRAMEF33PRAMEF15: 13.315.581–13.322.598, Plus-StrangPRAMEF15PRAMEF14: 13.341.892–13.347.134, Minus-StrangPRAMEF14PRAMEF19: 13.368.431–13.371.947, Minus-StrangPRAMEF19PRAMEF17: 13.389.632–13.392.629, Plus-StrangPRAMEF17PRAMEF20: 13.410.450–13.421.328, Plus-StrangPRAMEF20LRRC38: 13.474.973–13.514.526, Minus-StrangLRRC38PDPN: 13.583.465–13.617.960, Plus-StrangPDPNPRDM2: 13.699.989–13.825.093, Plus-StrangPRDM2Diagramm von PRAMEF14: 4 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 1Exon 4: 13.341.892–13.343.086, 1.195 BasenExon 3: 13.344.038–13.344.616, 579 BasenExon 2: 13.345.028–13.345.339, 312 BasenExon 1: 13.347.057–13.347.134, 78 Basen43215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 2,2 kb der 5,2 kb des Gens aus; 1.425 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von PRAMEF14

63Schwer

Wie schwer sich PRAMEF14 mit Short Reads sequenzieren lässt, von 100

Ein großer Teil von PRAMEF14 liegt dort, wo Short Reads eine Veränderung übersehen oder falsch zuordnen können.

Was hinzukommt: der Anteil der Exons von PRAMEF14 in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability95 %
  • Homologie100 %
  • Wiederholungen0,8 %
  • GC-Gehalt0 %
  • Referenzabdeckung0 %

Ein Score von Dante Labs aus eigener Forschung, basierend auf den Genome-in-a-Bottle-Karten des NIST für schwer sequenzierbare Regionen.So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). PRAMEF14-Gen: PRAME family member 14. Abgerufen am 18. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/pramef14

Vancouver

Dante Labs. PRAMEF14-Gen: PRAME family member 14 [Internet]. [zitiert am 18. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/pramef14

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