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Gen

HNRNPCL2

heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C like 2

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
1p36.21
Koordinaten
Chromosom 1: 13.115.488–13.116.854 (GRCh38)
Exons
2 Exons über 1,4 kb
Protein
293 Aminosäuren
Frühere Symbole
HNRNPCP5
MANE-Select-Transkript
ENST00000621994.3NM_001136561.3
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet HNRNPCL2 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von HNRNPCL2

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 1, mit einer Klammer, an der HNRNPCL2 liegt. HNRNPCL2 und 31 Gene in der Nähe auf Chromosom 1, von 12.616.171 bis 13.616.170.Chromosom 11p36.21p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4412,8 Mb13 Mb13,2 Mb13,4 Mb13,6 MbDHRS3: 12.563.619–12.620.183, Minus-StrangDHRS3AADACL4: 12.644.085–12.667.076, Plus-StrangAADACL4AADACL3: 12.716.109–12.728.760, Plus-StrangAADACL3CFAP107: 12.746.194–12.763.699, Plus-StrangCFAP107PRAMEF12: 12.773.738–12.777.906, Plus-StrangPRAMEF12PRAMEF1: 12.791.397–12.796.628, Plus-StrangPRAMEF1PRAMEF11: 12.824.605–12.831.410, Minus-StrangHNRNPCL1: 12.847.377–12.848.720, Minus-StrangPRAMEF2: 12.857.086–12.861.909, Plus-StrangPRAMEF2PRAMEF4: 12.879.212–12.886.201, Minus-StrangPRAMEF4PRAMEF10: 12.892.250–12.898.270, Minus-StrangPRAMEF10PRAMEF7: 12.916.610–12.920.751, Plus-StrangPRAMEF7PRAMEF6: 12.938.472–12.947.580, Minus-StrangPRAMEF6PRAMEF27: 13.049.476–13.056.575, Minus-StrangPRAMEF27HNRNPCL3: 13.060.769–13.062.878, Plus-StrangHNRNPCL3PRAMEF25: 13.068.677–13.077.884, Plus-StrangPRAMEF25HNRNPCL2: 13.115.488–13.116.854, Minus-StrangHNRNPCL2PRAMEF26: 13.148.905–13.158.116, Minus-StrangPRAMEF26HNRNPCL4: 13.163.914–13.165.631, Minus-StrangHNRNPCL4PRAMEF9: 13.171.848–13.179.459, Plus-StrangPRAMEF9PRAMEF13: 13.196.188–13.201.409, Minus-StrangPRAMEF13PRAMEF18: 13.222.695–13.226.154, Minus-StrangPRAMEF5: 13.254.198–13.263.435, Plus-StrangPRAMEF5PRAMEF8: 13.281.304–13.285.137, Minus-StrangPRAMEF8PRAMEF33: 13.303.539–13.308.907, Plus-StrangPRAMEF33PRAMEF15: 13.315.581–13.322.598, Plus-StrangPRAMEF15PRAMEF14: 13.341.892–13.347.134, Minus-StrangPRAMEF14PRAMEF19: 13.368.431–13.371.947, Minus-StrangPRAMEF19PRAMEF17: 13.389.632–13.392.629, Plus-StrangPRAMEF17PRAMEF20: 13.410.450–13.421.328, Plus-StrangPRAMEF20LRRC38: 13.474.973–13.514.526, Minus-StrangLRRC38PDPN: 13.583.465–13.617.960, Plus-StrangPDPNDiagramm von HNRNPCL2: 2 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 1Exon 2: 13.115.488–13.116.581, 1.094 BasenExon 1: 13.116.793–13.116.854, 62 Basen215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 1,2 kb der 1,4 kb des Gens aus; 882 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von HNRNPCL2

93Schwer

Wie schwer sich HNRNPCL2 mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Ein großer Teil von HNRNPCL2 liegt in Bereichen, in denen Short Reads eine Veränderung übersehen oder falsch zuordnen können.

Dazu kommt der Anteil der Exons von HNRNPCL2 in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability82 %
  • Homologie100 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenzabdeckung0 %
  • Wiederholungen2,1 %
  • GC-Gehalt0 %

Ein Dante-Labs-Score aus unserer eigenen Forschung, basierend auf den Karten schwer sequenzierbarer Regionen aus Genome in a Bottle des NIST.So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). HNRNPCL2-Gen: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C like 2. Abgerufen am 19. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/hnrnpcl2

Vancouver

Dante Labs. HNRNPCL2-Gen: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C like 2 [Internet]. [zitiert am 19. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/hnrnpcl2

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