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Gen

GJE1

gap junction protein epsilon 1

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
6q24.1
Koordinaten
Chromosom 6: 142.132.925–142.135.358 (GRCh38)
Exons
3 Exons über 2,4 kb
Protein
205 Aminosäuren
Auch bekannt als
CX23
MANE-Select-Transkript
ENST00000450456.3NM_001358410.2
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet GJE1 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von GJE1

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
Chromosom 6, mit einer Klammer, an der GJE1 liegt. GJE1 und 3 Gene in der Nähe auf Chromosom 6, von 141.634.142 bis 142.634.141.Chromosom 66q24.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q27141,8 Mb142 Mb142,2 Mb142,4 Mb142,6 MbNMBR: 142.058.330–142.147.122, Minus-StrangNMBRGJE1: 142.132.925–142.135.358, Plus-StrangGJE1VTA1: 142.147.162–142.224.685, Plus-StrangVTA1ADGRG6: 142.301.502–142.447.264, Plus-StrangADGRG6Diagramm von GJE1: 3 Exons auf dem Plus-Strang von Chromosom 6Exon 1: 142.132.925–142.133.197, 273 BasenExon 2: 142.133.850–142.134.044, 195 BasenExon 3: 142.134.539–142.135.358, 820 Basen1235′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 1,3 kb der 2,4 kb des Gens aus; 618 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von GJE1

1Leicht

Wie schwer sich GJE1 mit Short Reads sequenzieren lässt, von 100

Nahezu alle Exons von GJE1 liegen dort, wo Short Reads sauber kartiert werden können.

Was hinzukommt: der Anteil der Exons von GJE1 in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability0 %
  • Homologie0 %
  • Wiederholungen4,4 %
  • GC-Gehalt4,8 %
  • Referenzabdeckung0 %

Ein Score von Dante Labs aus eigener Forschung, basierend auf den Genome-in-a-Bottle-Karten des NIST für schwer sequenzierbare Regionen.So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). GJE1-Gen: gap junction protein epsilon 1. Abgerufen am 18. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/gje1

Vancouver

Dante Labs. GJE1-Gen: gap junction protein epsilon 1 [Internet]. [zitiert am 18. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/gje1

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