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Gen

C15orf40

chromosome 15 open reading frame 40

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
15q25.2
Koordinaten
Chromosom 15: 82.994.817–83.011.639 (GRCh38)
Exons
4 Exons über 16,8 kb
Protein
153 Aminosäuren
Auch bekannt als
MGC29937
MANE-Select-Transkript
ENST00000304177.10NM_144597.3
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet C15orf40 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von C15orf40

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 15, mit einer Klammer, an der C15orf40 liegt. C15orf40 und 13 Gene in der Nähe auf Chromosom 15, von 82.503.228 bis 83.503.227.Chromosom 1515q25.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.382,6 Mb82,8 Mb83 Mb83,2 Mb83,4 MbRPS17: 82.536.592–82.540.622, Minus-StrangRPS17: 82.536.788–82.573.194, Minus-StrangCPEB1: 82.543.201–82.648.861, Minus-StrangCPEB1AP3B2: 82.659.281–82.710.112, Minus-StrangAP3B2FSD2: 82.755.362–82.806.148, Minus-StrangFSD2WHAMM: 82.809.581–82.836.108, Plus-StrangWHAMMHOMER2: 82.834.664–82.986.153, Minus-StrangHOMER2RAMAC: 82.986.199–82.991.057, Plus-StrangRAMACC15orf40: 82.994.817–83.011.639, Minus-StrangC15orf40BTBD1: 83.016.423–83.067.412, Minus-StrangBTBD1TM6SF1: 83.107.369–83.161.068, Plus-StrangTM6SF1HDGFL3: 83.112.738–83.208.424, Minus-StrangHDGFL3BNC1: 83.255.884–83.284.664, Minus-StrangBNC1SH3GL3: 83.447.228–83.618.747, Plus-StrangSH3GL3Diagramm von C15orf40: 4 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 15Exon 4: 82.994.817–83.005.692, 10.876 BasenExon 3: 83.008.548–83.008.675, 128 BasenExon 2: 83.010.237–83.010.363, 127 BasenExon 1: 83.011.497–83.011.639, 143 Basen43215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 11,3 kb der 16,8 kb des Gens aus; 462 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von C15orf40

24Mittel

Wie schwer sich C15orf40 mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Einige Exons von C15orf40 liegen in Bereichen, in denen Short Reads eine Veränderung übersehen oder falsch zuordnen können.

Was hinzukommt: der Anteil der Exons von C15orf40 in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability18 %
  • Homologie0 %
  • Gemeinsam mit chrY0 %
  • Abdeckung der Referenz0 %
  • Wiederholungen16 %
  • GC-Gehalt16 %

Ein Score von Dante Labs aus eigener Forschung, basierend auf den Karten schwer zu sequenzierender Regionen von NIST (Genome in a Bottle).So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). C15orf40-Gen: chromosome 15 open reading frame 40. Abgerufen am 19. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/c15orf40

Vancouver

Dante Labs. C15orf40-Gen: chromosome 15 open reading frame 40 [Internet]. [zitiert am 19. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/c15orf40

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