Genetische Methylierungsuntersuchungen – der Methylierungszyklus umfasst Dutzende von Genen neben MTHFR, und bei der Gesamtgenomsequenzierung werden alle diese Gene untersucht – MTRR, MTR, BHMT, CBS, COMT, MAT1A, AHCY –, wodurch ein vollständiges genetisches Methylierungsprofil erstellt wird.
Bei der Gesamtgenomsequenzierung werden alle Gene des Methylierungszyklus gleichzeitig untersucht – nicht nur die beiden gängigen MTHFR-Varianten (C677T, A1298C), die bei Standard-Screenings getestet werden, sondern jede einzelne Variante in jedem Gen der Folat-, Methionin- und Transsulfurationswege.
Genetische Methylierungsuntersuchungen
Der Methylierungszyklus (Einkohlenstoff-Stoffwechsel) ist ein zentraler Stoffwechselweg, der Methylgruppen für die DNA-Methylierung, die Neurotransmittersynthese, die Entgiftung, die Phospholipidproduktion und den Homocystein-Stoffwechsel bereitstellt. An diesem Stoffwechselweg sind mehrere Enzyme beteiligt: MTHFR (Methylentetrahydrofolatreduktase – wandelt 5,10-Methylen-THF in 5-Methyl-THF, die aktive Form von Folat, um), MTR (Methioninsynthase – wandelt Homocystein unter Verwendung von B12 in Methionin um), MTRR (Methioninsynthase-Reduktase – regeneriert aktives B12 für MTR), BHMT (Betain-Homocystein-Methyltransferase – alternativer Homocystein-Umwandlungsweg), CBS (Cystathionin-Beta-Synthase – Transsulfurationsweg) und COMT (Catechol-O-Methyltransferase – Neurotransmitter-Methylierung).
MTHFR C677T (rs1801133) ist die am besten untersuchte Methylierungsvariante: Der homozygote TT-Genotyp (~10–12 % der Bevölkerung europäischer Abstammung) verringert die MTHFR-Enzymaktivität um ~70 %, was möglicherweise zu erhöhten Homocysteinspiegeln (einem kardiovaskulären Risikofaktor) und einer verminderten Verfügbarkeit von Methylfolat führt. MTHFR A1298C (rs1801131) verringert die Aktivität bei Homozygoten um ~35 %. Der Methylierungszyklus ist jedoch ein Netzwerk – einzelne Varianten in anderen Genen (MTRR A66G, MTR A2756G, CBS C699T, COMT Val158Met) können MTHFR-Varianten verstärken oder kompensieren. Standardtests, die sich ausschließlich auf MTHFR beziehen, lassen diese Komplexität des Netzwerks außer Acht.
Zu den klinischen Auswirkungen von Methylierungsvarianten zählen: erhöhte Homocysteinkonzentrationen (kardiovaskuläres Risiko – behandelbar durch die Einnahme von Methylfolat und aktivem Vitamin B12), das Risiko für Neuralrohrdefekte in der Schwangerschaft (Frauen mit MTHFR-TT-Genotyp profitieren eher von Methylfolat als von Folsäure), ein variabler Arzneimittelstoffwechsel (COMT Val158Met beeinflusst den Katecholaminstoffwechsel, die Schmerzempfindlichkeit und das Ansprechen auf bestimmte Medikamente) sowie CBS-Varianten, die den Schwefelstoffwechsel und Entgiftungswege beeinflussen können. Umfassende Methylierungstests, die den gesamten Stoffwechselweg bewerten – nicht nur eine oder zwei MTHFR-Varianten –, liefern ein vollständiges Bild für eine personalisierte Supplementierung.
Standardmäßige MTHFR-Tests untersuchen nur zwei Varianten (C677T und A1298C). Am Methylierungszyklus sind über 20 Gene mit Hunderten von funktionellen Varianten beteiligt. Die Gesamtgenomsequenzierung (WGS) wertet alle diese Gene aus und liefert so ein umfassendes Profil, das mit unvollständigen Tests nicht erreicht werden kann.
Die Methylierung ist ein Stoffwechselweg, kein einzelnes Gen. Bei einer Untersuchung, die sich nur auf die MTHFR-Varianten C677T und A1298C beschränkt, wird der Großteil der genetischen Variationen übersehen, die den Folat-, Vitamin-B12- und Homocystein-Stoffwechsel beeinflussen. Die Gesamtgenomsequenzierung (WGS) erfasst den gesamten Stoffwechselweg.
Bei einer reinen MTHFR-Untersuchung wird das Netzwerk übersehen – Varianten von MTRR, MTR, BHMT und CBS können den MTHFR-Genotyp verstärken oder kompensieren
Ein Patient mit MTHFR 677 CT (heterozygot, leichte Beeinträchtigung), der zudem MTRR 66 GG (vermindertes B12-Recycling) und MTR 2756 GG (verringerte Methioninsynthase-Aktivität) aufweist, kann eine deutlich beeinträchtigte Methylierung aufweisen – stärker als allein aufgrund des MTHFR-Befunds zu erwarten wäre. Umgekehrt kann ein Patient mit MTHFR 677 TT, aber günstigen BHMT- und CBS-Genotypen dies durch alternative Stoffwechselwege kompensieren. Nur eine umfassende Untersuchung des gesamten Stoffwechselwegs gibt Aufschluss über die Netto-Methylierungsfähigkeit.
Die COMT-Variante Val158Met beeinflusst die Schmerzempfindlichkeit, den Katecholaminstoffwechsel und das Ansprechen auf die Hormonersatztherapie – eine pharmakogenomische Variante mit weitreichenden klinischen Auswirkungen
COMT Val158Met (rs4680) bestimmt die COMT-Enzymaktivität: Val/Val (hohe Aktivität, schneller Abbau von Katecholaminen – „Kämpfer“-Phänotyp), Met/Met (geringe Aktivität, höhere Katecholaminspiegel – „Sorgenmacher“-Phänotyp) und Val/Met (mittlerer Wert). Diese Variante beeinflusst die Schmerzempfindlichkeit, die Stressreaktion, die kognitive Leistungsfähigkeit unter Druck, den Östrogenstoffwechsel und die Reaktion auf bestimmte Medikamente. COMT ist Teil des Methylierungszyklus – es nutzt SAM (S-Adenosylmethionin) als Methylspender. WGS bietet die COMT-Genotypisierung zusammen mit allen anderen Methylierungsgenen an.
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Häufig gestellte Fragen zur Gesamtgenomsequenzierung.
Was ist der Unterschied zwischen einer Gesamtgenomsequenzierung und einem gezielten Gentest?
Gezielte Gentests – einschließlich der üblichen Panels für erblich bedingten Krebs – untersuchen eine vordefinierte Liste bekannter Varianten in einer bestimmten Gruppe von Genen. Sie sind darauf ausgelegt, genau das zu finden, wonach sie bereits suchen. Bei der Gesamtgenomsequenzierung wird Ihr gesamtes Genom untersucht: alle 6 Milliarden Basenpaare, jedes Gen, jede Region zwischen den Genen. Eine in JAMA Oncology veröffentlichte Studie der Mayo Clinic ergab, dass bei Standardtests mehr als die Hälfte der Patienten mit vererbten Krebsmutationen übersehen wurde. Der Genomtest verfügt über keine festgelegte Liste.
Was erhalte ich, wenn meine Ergebnisse vorliegen?
Ihr Dante-Genom liefert über 200 für Ärzte aufbereitete Berichte, die nach klinischen Kategorien geordnet sind – erblicher Krebs, Herzerkrankungen, seltene Krankheiten, Pharmakogenomik, Trägerstatus und mehr. Die Berichte werden in Ihren sicheren Genome Manager übermittelt und sind für den direkten klinischen Einsatz formatiert. Ihre Genomdaten werden dauerhaft gespeichert und im Zuge des wissenschaftlichen Fortschritts automatisch neu analysiert.
Was passiert, wenn eine klinisch relevante Variante gefunden wird?
Sollte eine pathogene oder wahrscheinlich pathogene Variante festgestellt werden, wird diese in Ihrem für Ärzte bestimmten Bericht deutlich gekennzeichnet und mit klinischem Kontext, veröffentlichten wissenschaftlichen Erkenntnissen sowie empfohlenen nächsten Schritten versehen. Wir empfehlen Ihnen, alle klinisch bedeutsamen Befunde mit Ihrem Arzt oder einem genetischen Berater zu besprechen, der Sie bei Entscheidungen bezüglich der Nachsorge, der Risikominderung oder der Kaskadenuntersuchung für Familienangehörige beraten kann.
Inwiefern unterscheidet sich dies von einem DNA-Test für Verbraucher wie 23andMe oder AncestryDNA?
DNA-Tests für Verbraucher verwenden Genotypisierungs-Chips, die weniger als 0,1 % Ihres Genoms auslesen – eine winzige vorab ausgewählte Gruppe häufiger Varianten. Sie sind auf die Ermittlung der Abstammung und auf Merkmale auf Populationsebene optimiert, nicht auf klinische genetische Befunde. Der Dante-Genomtest sequenziert 100 % Ihres Genoms mit einer 30-fachen Abdeckung, dem gleichen Standard, der auch in der klinischen Diagnostik verwendet wird. Die beiden Tests sind hinsichtlich Umfang, Methodik oder klinischem Nutzen nicht vergleichbar.
Wie lange dauert es, bis Ergebnisse vorliegen, und wie werden diese übermittelt?
Ihr Entnahmeset wird innerhalb von 48 Stunden nach der Bestellung versandt. Sobald Ihre Probe in unserem CLIA-zertifizierten Labor eintrifft, dauern die Sequenzierung und Analyse 6–8 Wochen. Die Ergebnisse werden sicher an Ihren Genome Manager übermittelt, wo Sie auf Ihre Berichte zugreifen, diese mit Ihrem Arzt teilen und automatische Benachrichtigungen erhalten können, sobald neue Erkenntnisse anhand Ihres Genoms validiert wurden.
Wir arbeiten weltweit mit Patientenorganisationen zusammen.
Dante Labs arbeitet mit Patientenorganisationen jeder Größe zusammen – im Bereich genetischer Methylierungsuntersuchungen sowie bei anderen Erkrankungen, ob selten oder häufig. Wir unterstützen Organisationen in jedem Land, einschließlich virtueller Patientenorganisationen.
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