Variant
TP53 D228X
NM_000546.6(TP53):c.681dup (p.Asp228Ter)
- p.Asp228Ter
- p.D228*
- rs1567550002
- ClinVar-klassifikation
- Patogen
- Gennemgangsstatus
- 2 stjerner ud af 4Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter
- Senest vurderet
- 1. oktober 2025
Data opdateret til ClinVar-udgave 2026-10-12 · Dante Labs-dataudgave 2026.10.19-9814e911Fakta sidst ændret 19. oktober 2026
Share this page
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tp53/variants/d228x.json"
page <- fromJSON(url)
page$variant$nameResumé
D228X er en nonsense-variant i TP53: Den skaber et tidligt stopsignal, så proteinet, som genet koder for, forventes at blive afkortet. ClinVar klassificerer den som patogen for Li-Fraumeni Syndrome (Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter).
ClinVar-klassifikationer
| Tilstand | Klassifikation | Gennemgangsstatus | Indsendelser | Senest vurderet |
|---|---|---|---|---|
| Li-Fraumeni SyndromeClinVar VCV000634696 (åbnes i en ny fane) | Patogen | 2 stjerner ud af 4Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter | 2 indsendelser | 1. oktober 2025 |
Klassifikationer, som ClinVar registrerer dem i udgave 2026-10-12. ClinVar opdaterer dem, efterhånden som dokumentationen gennemgås.
ACMG/AMP-kriterier
ACMG/AMP-kriterierne, som D228X opfylder, ud fra dens forudsagte effekt i TP53, gnomAD og ClinVar.
| Kriterie | Styrke | Point | Bygger på |
|---|---|---|---|
| PVS1Null-variant, hvor tab af funktion forårsager sygdom | Meget stærk | +8 | stop_gained på NM_000546.6Forventes at forårsage nonsens-medieret nedbrydningDet blev ikke kontrolleret, om tab af funktion forårsager sygdom i dette gen |
| PM2Fraværende eller meget sjælden i populationsdatabaser | Understøttende | +1 | Ikke set i gnomAD exomes og gnomAD genomes |
| PP5En anerkendt kilde rapporterer den som patogen | Understøttende | Ikke medregnet | ClinVar: Patogen (Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter) |
Alene ud fra disse kriterier: +9 point, sandsynligvis patogen.
Vurderet automatisk, uden funktionelle, computationelle eller familiemæssige data. Ikke en klinisk klassifikation.
Populationsfrekvens
Hvor ofte D228X ses blandt de personer, hvis exomer og genomer gnomAD 4.1 samler.
| Datasæt | Allelfrekvens | Allelantal | Homozygote | Hyppigst i |
|---|---|---|---|---|
| gnomAD exomes | Ikke set | 0 af 0 | 0 | |
| gnomAD genomes | Ikke set | 0 af 0 | 0 |
Tal fra gnomAD 4.1, som gnomAD offentliggør dem. Grupperne er genetiske herkomstgrupper, som gnomAD udleder dem. De beskriver varianten i gnomADs populationer, ikke nogens resultat.
Hvor den ligger i TP53
D228X ligger i exon 7 af de 11 i TP53s MANE Select-transkript, NM_000546.6.
Molekylære detaljer
| Gen | TP53 |
|---|---|
| Transkript | NM_000546.6MANE Select |
| Ændring i kodende DNA (HGVS c.) | c.681dup |
| Proteinændring (HGVS p.) | p.Asp228Terp.D228* |
| Forventet konsekvens | Nonsens (stopkodon dannet)stop_gained (åbnes i en ny fane) |
| Forventet påvirkning | Høj |
| Position (GRCh38) | chr17:7674281 C>CA |
| Position (GRCh37) | chr17:7577599 C>CA |
| dbSNP-ID | rs1567550002 (åbnes i en ny fane) |
| ClinVar-variations-ID | VCV000634696 (åbnes i en ny fane) |
| ClinVar-allel-ID | 622597 |
| ClinGen Allele Registry-ID | CA645588679 (åbnes i en ny fane) |
| ClinVar-navn | NM_000546.6(TP53):c.681dup (p.Asp228Ter) |
TP53 D228X i andre databaser
Rapporter, der ser på denne variant (1)
Disse Genome Test-tilstandsrapporter omfatter D228X blandt de varianter, de ser på.
| Rapport | Tilstande | Arvelighed |
|---|---|---|
| Li-Fraumeni Syndrome | Li-Fraumeni Syndrome | Autosomal dominant |
Andre varianter i TP53
- A138PSandsynligvis patogen3 stjerner ud af 4
- A138VSandsynligvis patogen3 stjerner ud af 4
- A161_Y163delinsDSandsynligvis patogen3 stjerner ud af 4
- A347DPatogen3 stjerner ud af 4
- c.-29+1G>TSandsynligvis patogen3 stjerner ud af 4
- c.97-1G>APatogen3 stjerner ud af 4
- c.375+5G>ASandsynligvis patogen3 stjerner ud af 4
- c.919+1G>APatogen3 stjerner ud af 4
- c.993+1delSandsynligvis patogen3 stjerner ud af 4
- C124XPatogen3 stjerner ud af 4
Begrænsninger
Denne side beskriver offentligt tilgængelige oplysninger om en genetisk variant. Den er ikke en diagnose, og den siger intet om, hvorvidt du eller andre bærer denne variant.
Klassificeringer stammer fra ClinVar og ændrer sig, når ny evidens gennemgås. En klassificering her kan afvige fra den, der står i ClinVar i dag, eller fra den, et laboratorium angiver.
Helgenomsekventering med korte læsninger kan overse eller fejlkalde nogle varianter, især i gentagne eller meget ens DNA-sekvenser og i store indsættelser, deletioner eller omlejringer.
Hvis du har spørgsmål om en variant i dine egne resultater eller i din familie, så tal med en genetisk rådgiver eller din læge.
Kilder og kreditering
- Klassificeringer fra ClinVar (udgivelse 2026-10-12), National Center for Biotechnology Information.
- Sygdomstermer fra Mondo Disease Ontology (udgivelse 2026-10-06), anvendt under CC BY 4.0.
- Gensymboler og -navne fra HUGO Gene Nomenclature Committee (udgivelse 2026-10-16).
- Allel-identifikatorer fra ClinGen Allele Registry (udgivelse 2026-10-19-c4908f54).
- Reference-SNP-identifikatorer fra dbSNP (udgivelse b157), National Center for Biotechnology Information.
- Gen–sygdom-forbindelser fra Gene Curation Coalition, GenCC (udgivelse 2026-10-19).
- Vanskelige regioner fra Genome in a Bottle Consortium (udgivelse v3.6).
- Transkripter fra MANE (udgivelse v1.5), NCBI og EMBL-EBI.
- Forudsagte konsekvenser fra mehari (udgivelse 0.11.0), med transkriptmodeller fra cdot.
- Bygget på Dante Labs datafrigivelse 2026.10.19-9814e911 af 19. oktober 2026.
Citer denne side
Dante Labs. (19. oktober 2026). TP53 D228X (c.681dup, rs1567550002) (version 2026.10.19-9814e911). Hentet 21. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/genes/tp53/variants/d228x
Dante Labs. TP53 D228X (c.681dup, rs1567550002) [Internet]. Version 2026.10.19-9814e911. 19. oktober 2026 [hentet 21. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/genes/tp53/variants/d228x
Læs dit fulde genom
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger