Variant
BRCA2 G3003X
NM_000059.4(BRCA2):c.9007G>T (p.Gly3003Ter)
- p.Gly3003Ter
- p.G3003*
- rs397508029
- ClinVar-klassifikation
- Patogen
- Gennemgangsstatus
- 3 stjerner ud af 4Gennemgået af ekspertpanel
- Senest vurderet
- 15. december 2017
- Ekspertpanel
- Evidence-based Network for the Interpretation of Germline Mutant Alleles (ENIGMA)
Data opdateret til ClinVar-udgave 2026-10-12 · Dante Labs-dataudgave 2026.10.19-9814e911Fakta sidst ændret 19. oktober 2026
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/brca2/variants/g3003x.json"
page <- fromJSON(url)
page$variant$nameResumé
G3003X er en nonsense-variant i BRCA2: Den skaber et tidligt stopsignal, så proteinet, som genet koder for, forventes at blive afkortet. ClinVar klassificerer den som patogen for breast-ovarian cancer, familial, susceptibility to, 2 (Gennemgået af ekspertpanel).
ClinVar-klassifikationer
| Tilstand | Klassifikation | Gennemgangsstatus | Indsendelser | Senest vurderet |
|---|---|---|---|---|
| breast-ovarian cancer, familial, susceptibility to, 2ClinVar VCV000052726 (åbnes i en ny fane) | Patogen | 3 stjerner ud af 4Gennemgået af ekspertpanel | 1 indsendelse | 15. december 2017 |
Klassifikationer, som ClinVar registrerer dem i udgave 2026-10-12. ClinVar opdaterer dem, efterhånden som dokumentationen gennemgås.
ACMG/AMP-kriterier
G3003X opfylder disse ACMG/AMP-kriterier ud fra den forudsagte effekt i BRCA2, gnomAD og ClinVar.
| Kriterium | Styrke | Bygger på |
|---|---|---|
| PVS1Nulvariant, hvor tab af funktion forårsager sygdom | Meget stærk | stop_gained på NM_000059.4 |
| PM2Fraværende eller meget sjælden i populationsdatabaser | Understøttende | Ikke set i gnomAD-exomer og gnomAD-genomer |
| PP5En anerkendt kilde angiver den som patogen | Understøttende | ClinVar: Patogen (Gennemgået af ekspertpanel) |
Alene ud fra disse kriterier: patogen.
Vurderet automatisk, uden funktionel, beregningsmæssig eller familiemæssig dokumentation. Er ikke en klinisk klassificering.
Populationsfrekvens
Hvor ofte G3003X ses blandt de personer, hvis exomer og genomer gnomAD 4.1 samler.
| Datasæt | Allelfrekvens | Allelantal | Homozygote | Hyppigst i |
|---|---|---|---|---|
| gnomAD-exomer | Ikke set | 0 af 0 | 0 | |
| gnomAD-genomer | Ikke set | 0 af 0 | 0 |
Tal fra gnomAD 4.1, som gnomAD offentliggør dem. Grupperne er genetiske herkomstgrupper, som gnomAD udleder dem. De beskriver varianten i gnomADs populationer, ikke nogens resultat.
Hvor den ligger i BRCA2
G3003X ligger i exon 23 af de 27 i BRCA2s MANE Select-transkript, NM_000059.4.
Molekylære detaljer
| Gen | BRCA2 |
|---|---|
| Transkript | NM_000059.4MANE Select |
| Ændring i kodende DNA (HGVS c.) | c.9007G>T |
| Proteinændring (HGVS p.) | p.Gly3003Terp.G3003* |
| Forventet konsekvens | Nonsens (stopkodon dannet)stop_gained (åbnes i en ny fane) |
| Forventet påvirkning | Høj |
| Position (GRCh38) | chr13:32379803 G>T |
| Position (GRCh37) | chr13:32953940 G>T |
| dbSNP-ID | rs397508029 (åbnes i en ny fane) |
| ClinVar-variations-ID | VCV000052726 (åbnes i en ny fane) |
| ClinVar-allel-ID | 67394 |
| ClinGen Allele Registry-ID | CA025922 (åbnes i en ny fane) |
| ClinVar-navn | NM_000059.4(BRCA2):c.9007G>T (p.Gly3003Ter) |
BRCA2 G3003X i andre databaser
Rapporter, der ser på denne variant (1)
Disse Genome Test-tilstandsrapporter omfatter G3003X blandt de varianter, de ser på.
| Rapport | Tilstande | Arvelighed |
|---|---|---|
| Hereditary Breast and Ovarian Cancer (BRCA1/2) | Hereditary Breast and Ovarian Cancer Syndrome | Autosomal dominant |
| BRCA2-related cancer predisposition | Autosomal dominant |
Andre varianter i BRCA2
- A22Qfs*3Patogen3 stjerner ud af 4
- A39Lfs*41Patogen3 stjerner ud af 4
- A75Dfs*26Patogen3 stjerner ud af 4
- A127Sfs*3Patogen3 stjerner ud af 4
- A199Hfs*11Patogen3 stjerner ud af 4
- A248Vfs*3Patogen3 stjerner ud af 4
- A483Gfs*31Patogen3 stjerner ud af 4
- A483Qfs*2Patogen3 stjerner ud af 4
- A495Ffs*17Patogen3 stjerner ud af 4
- A518Qfs*7Patogen3 stjerner ud af 4
Begrænsninger
Denne side beskriver offentligt tilgængelige oplysninger om en genetisk variant. Den er ikke en diagnose, og den siger intet om, hvorvidt du eller andre bærer denne variant.
Klassificeringer stammer fra ClinVar og ændrer sig, når ny evidens gennemgås. En klassificering her kan afvige fra den, der står i ClinVar i dag, eller fra den, et laboratorium angiver.
Helgenomsekventering med korte læsninger kan overse eller fejlkalde nogle varianter, især i gentagne eller meget ens DNA-sekvenser og i store indsættelser, deletioner eller omlejringer.
Hvis du har spørgsmål om en variant i dine egne resultater eller i din familie, så tal med en genetisk rådgiver eller din læge.
Kilder og kreditering
- Klassificeringer fra ClinVar (udgivelse 2026-10-12), National Center for Biotechnology Information.
- Sygdomstermer fra Mondo Disease Ontology (udgivelse 2026-10-06), anvendt under CC BY 4.0.
- Gensymboler og -navne fra HUGO Gene Nomenclature Committee (udgivelse 2026-10-16).
- Allel-identifikatorer fra ClinGen Allele Registry (udgivelse 2026-10-19-c4908f54).
- Reference-SNP-identifikatorer fra dbSNP (udgivelse b157), National Center for Biotechnology Information.
- Gen–sygdom-forbindelser fra Gene Curation Coalition, GenCC (udgivelse 2026-10-19).
- Vanskelige regioner fra Genome in a Bottle Consortium (udgivelse v3.6).
- Transkripter fra MANE (udgivelse v1.5), NCBI og EMBL-EBI.
- Forudsagte konsekvenser fra mehari (udgivelse 0.11.0), med transkriptmodeller fra cdot.
- Bygget på Dante Labs datafrigivelse 2026.10.19-9814e911 af 19. oktober 2026.
Citer denne side
Dante Labs. (19. oktober 2026). BRCA2 G3003X (c.9007G>T, rs397508029) (version 2026.10.19-9814e911). Hentet 20. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/genes/brca2/variants/g3003x
Dante Labs. BRCA2 G3003X (c.9007G>T, rs397508029) [Internet]. Version 2026.10.19-9814e911. 19. oktober 2026 [hentet 20. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/genes/brca2/variants/g3003x
Læs dit fulde genom
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger