Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

C4orf46

chromosome 4 open reading frame 46

Shrnutí

Cytogenetická poloha
4q32.1
Souřadnice
Chromozom 4: 158 666 675–158 671 887 (GRCh38)
Exony
2 exonů na 5,2 kb
Protein
113 aminokyselin
Další názvy
LOC201725, RCDG1
Transkript MANE Select
ENST00000379205.5NM_001008393.4
Typ lokusu
Kódující proteiny
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen C4orf46. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je C4orf46 uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 4, se závorkou u C4orf46. C4orf46 a 8 genů poblíž na chromozomu 4, od 158 169 281 do 159 169 280.Chromozom 44q32.1p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.2158,2 Mb158,4 Mb158,6 Mb158,8 Mb159 MbGASK1B: 158 123 836–158 174 249, řetězec zpětnémGASK1BTMEM144: 158 201 604–158 255 416, řetězec dopřednémTMEM144RXFP1: 158 315 311–158 653 372, řetězec dopřednémRXFP1C4orf46: 158 666 675–158 671 887, řetězec zpětnémC4orf46ETFDH: 158 671 968–158 710 758, řetězec dopřednémETFDHPPID: 158 708 161–158 723 418, řetězec zpětnémPPIDFNIP2: 158 768 963–158 908 050, řetězec dopřednémFNIP2SPMIP2: 158 893 134–159 038 760, řetězec zpětnémSPMIP2RAPGEF2: 159 103 013–159 360 175, řetězec dopřednémRAPGEF2Schéma C4orf46: 2 exonů na zpětném řetězci chromozomu 4Exon 2: 158 666 675–158 669 768, 3 094 bázíExon 1: 158 671 616–158 671 887, 272 bází215′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 3,4 kb z 5,2 kb genu; 342 těchto bází kódují protein.

Sekvenování C4orf46

7Snadné

Jak obtížné je sekvenovat C4orf46 krátkými čteními, ze 100

Téměř všechny exony genu C4orf46 leží v místech, kde se krátká čtení spolehlivě mapují.

Co k tomu přispívá: podíl exonů genu C4orf46 v jednotlivých typech obtížných oblastí

  • Mapovatelnost0,5 %
  • Homologie0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Pokrytí referenčního genomu0 %
  • Repetice4,6 %
  • Obsah GC27 %

Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, založené na mapách obtížně sekvenovatelných oblastí Genome in a Bottle od NIST.Jak se skóre počítá

Externí odkazy

Odkud to pochází

  • HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen C4orf46: chromosome 4 open reading frame 46. Staženo 19. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/c4orf46

Vancouver

Dante Labs. Gen C4orf46: chromosome 4 open reading frame 46 [Internet]. [citováno 19. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/c4orf46

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test