أوكسفورد نانوبور مقابل باكبيو: عصر جديد في تسلسل الجيل الطويل

مقدمة

في عالم الجينوميات الذي يشهد تطوراً سريعاً، أصبحت تقنيات التسلسل ذات القراءات الطويلة أساسيةً لتحديد المناطق الجينومية المعقدة، والتغيرات الهيكلية، والنسخ الجينية الكاملة. ومن أبرز المنصات في هذا المجال كل من «أوكسفورد نانوبور تكنولوجيز» (ONT) و«باسيفيك بيوساينسز» (PacBio). وتتمتع كل منهما بمزايا فريدة، كما أنها تساهم في تشكيل الطريقة التي يتبعها الباحثون في إجراء عمليات التسلسل، ولكن كيف يمكن مقارنتهما؟

ما هو التسلسل طويل القراءة؟

يشير مصطلح «التسلسل طويل القراءة» إلى التقنيات القادرة على قراءة شظايا الحمض النووي (DNA) أو الحمض النووي الريبي (RNA) التي يبلغ طولها آلاف أو حتى ملايين القواعد في عملية قراءة واحدة. ويتيح ذلك تجميعًا أفضل للجينوم، وتقليل الفجوات، وتحسين الكشف عن المتغيرات الهيكلية مقارنةً بطرق القراءة القصيرة.

شركة «أوكسفورد نانوبور تكنولوجيز» (ONT)

كيف يعمل

تستخدم تقنية ONT مسامات نانوية مدمجة في غشاء. وعندما تمر خيوط الحمض النووي (DNA) أو الحمض النووي الريبي (RNA) عبر المسامات النانوية، يتم قياس التغيرات في التيار الكهربائي لتحديد كل قاعدة في الوقت الفعلي.

نقاط القوة الرئيسية

• بث البيانات في الوقت الفعلي
• الأجهزة المحمولة (مثل MinION)
• قابل للتوسع من المختبرات الصغيرة إلى المشاريع التي تشمل السكان بأكملهم
• قراءات فائقة الطول (يمكن أن تتجاوز 1 ميغابايت)
• تحديثات مستمرة في مجالي الكيمياء والبرمجيات

حالات الاستخدام

مثالي للتسلسل الميداني، والكشف السريع عن مسببات الأمراض، وعلم الميتاجينوم، والمشاريع التي تتطلب قابلية النقل أو تحليل البيانات في الموقع.

شركة باسيفيك بيوساينسز (PacBio)

كيف يعمل

يستخدم تسلسل SMRT (تسلسل الجزيء الواحد في الوقت الحقيقي) من PacBio موجات دليلية من النوع «صفر» لمراقبة إنزيم بوليميريز الحمض النووي أثناء قيامه بتخليق حمض نووي جديد، حيث يلتقط الإشارات الفلورية الصادرة عن النيوكليوتيدات الموسومة.

نقاط القوة الرئيسية

• دقة عالية مع قراءات HiFi (Q20+)
• ممتاز لتحديد المتغيرات الهيكلية
• دعم قوي لعمليات التجميع من الصفر
• تحسينات مستمرة في الإنتاجية والسرعة

حالات الاستخدام

مثالي لتجميع الجينوم على مستوى مرجعي، وعلم النسخ الجيني، وعلم التخلق، والتطبيقات التي تتطلب قراءات عالية الدقة.

مقارنة جنبًا إلى جنب

أيهما يجب أن تختار؟

يعتمد الجواب على أهداف مشروعك:

• اختر Oxford Nanopore إذا كنت بحاجة إلى قابلية الحمل، أو نتائج فورية، أو قراءات طويلة جدًّا.
• اختر PacBio إذا كانت أولويتك هي الدقة الفائقة والكشف عن المتغيرات الهيكلية.

الدعم الذي نقدمه في «دانتي أوميكس أي آي»

في شركة «دانتي أوميكس إيه آي»، نقدم الدعم لكلا المنصتين ونوجه عملاءنا نحو أفضل استراتيجية للتسلسل الجيني بما يتناسب مع احتياجاتهم الفريدة. وسواء كنت تعمل على الجينومات المعقدة، أو علم النسخ الجيني، أو الدراسات على نطاق السكان، فإن فريقنا المتخصص في المعلوماتية الحيوية يضمن تفسيرًا دقيقًا ونتائج موثوقة.

الخلاصة

أحدثت كل من شركتي «أوكسفورد نانوبور» و«باكبيو» ثورة في مجال التسلسل الجيني طويل القراءة بطرق مختلفة. ويساعد فهم نقاط القوة الخاصة بكل منهما الباحثين والأطباء على اتخاذ قرارات مستنيرة فيما يتعلق بسير عملهم في مجال الجينوم.

إذا كنت بحاجة إلى المساعدة في اختيار المنصة المناسبة أو ترغب في التعرف على خدماتنا في مجال التسلسل الجيني وتفسير البيانات، فاتصل بنا اليوم.