Gen
RND3
Rho family GTPase 3
- HGNC 671↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000115963↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 390↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 2q23.3
- Koordinatlar
- Kromozom 2: 150.468.195–150.487.667 (GRCh38)
- Eksonlar
- 19,5 kb boyunca 6 ekson
- Protein
- 244 amino asit
- Diğer adları
- RhoE, Rho8
- Önceki semboller
- ARHE
- MANE Select transkripti
- ENST00000263895.9NM_005168.5
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnd3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameRND3 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Hiçbir Genome Test raporu RND3 genini henüz okumuyor. Test tüm genomunuzu dizilediği için bu gen yine de verilerinize dahildir.
RND3 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 19,5 kb uzunluğunun 2,7 kb'sini oluşturur; bu bazların 735 tanesi proteini kodlar.
RND3 dizilemesi
0Kolay
RND3 geninin kısa okumalarla dizilenmesinin ne kadar zor olduğu, 100 üzerinden
0 · Easy100 · Hard
Almost all of RND3's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of RND3's exons in each kind of hard region
- Eşleştirilebilirlik100 veya 250 baz çiftlik okumaların tek bir yere yerleştirilemediği bölgeler; bu nedenle buradaki çağrılar eksik veya yanlış olabilir. Ağırlık %35.%0
- HomolojiSegmental duplikasyonlar: genomun başka yerlerindeki, paraloglar ve psödogenler gibi, %90 veya daha yüksek benzerlikte kopyalar. Ağırlık %30.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve tümüyle kapsayamayabileceği ardışık tekrarlar ve tek bazlı uzun diziler. Ağırlık %15.%2,2
- GC içeriğiKütüphane hazırlığının seyrek kapsadığı, G ve C oranı %25'in altında veya %65'in üzerinde olan pencereler. Ağırlık %10.%1,6
- Referans kapsamıYakındaki referans dizisindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizi bulunmayan yerler. Ağırlık %10.%0
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredHer çubuk, RND3 ekzon bazlarının bu tür zor bölgelerdeki payını gösterir. Puan, her birinin kısa okuma çağrısına ne kadar maliyet getirdiğine göre ağırlık verir: hiçbir baz herhangi birinde değilse 0, her baz hepsindeyse 100.
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). RND3 geni: Rho family GTPase 3. Erişim tarihi: 18 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/rnd3
Dante Labs. RND3 geni: Rho family GTPase 3 [Internet]. [alıntı tarihi 18 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/rnd3
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde