Gen
ATP11B
ATPase phospholipid transporting 11B (putative)
- HGNC 13553↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000058063↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 23200↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 3q26.33
- Koordinatlar
- Kromozom 3: 182.793.504–182.921.629 (GRCh38)
- Eksonlar
- 128,1 kb boyunca 30 ekson
- Protein
- 1.177 amino asit
- Diğer adları
- ATPIF, ATPIR, KIAA0956
- MANE Select transkripti
- ENST00000323116.10NM_014616.3
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/atp11b.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameATP11B ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Hiçbir Genome Test raporu ATP11B genini henüz okumuyor. Test tüm genomunuzu dizilediği için bu gen yine de verilerinize dahildir.
ATP11B geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 128,1 kb uzunluğunun 7,3 kb'sini oluşturur; bu bazların 3.534 tanesi proteini kodlar.
ATP11B dizilemesi
2Düşük
100 üzerinden, ATP11B genini kısa okumalarla dizilemenin ne kadar zor olduğuHer çubuk, ATP11B geninin ekson bazlarının bu tür zorlu bölgelerdeki payını gösterir. Puan, bunları kısa okuma çağrısına maliyetlerine göre ağırlıklandırır: hiçbir baz herhangi birinde yer almadığında 0, her baz hepsinde yer aldığında 100.
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek anlamlı şekilde yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik ya da hatalı olabilir. Ağırlık %35.%0
- HomolojiSegmental duplikasyonlar: paralog ve psödogenler gibi genomun başka yerlerindeki, %90 ve üzeri benzerlikteki kopyalar. Ağırlık %30.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve kapsayamayabileceği tandem tekrarlar ile tek baz dizileri. Ağırlık %15.%2,6
- GC içeriği%25'in altında veya %65'in üzerinde G ve C oranına sahip pencereler; kütüphane hazırlığının yetersiz kapsadığı alanlar. Ağırlık %10.%15
- Referans kapsamıYakındaki referans dizilimindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizinin bulunmadığı bölgeler. Ağırlık %10.%0
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). ATP11B geni: ATPase phospholipid transporting 11B (putative). Erişim tarihi: 17 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/atp11b
Dante Labs. ATP11B geni: ATPase phospholipid transporting 11B (putative) [Internet]. [alıntı tarihi 17 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/atp11b
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde