Gen
ZNG1E
Zn regulated GTPase metalloprotein activator 1E
- HGNC 24584↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000147996↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 220869↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 9q21.11
- Koordinater
- Kromosom 9: 65 675 928–65 734 041 (GRCh38)
- Exoner
- 15 exoner på 58,1 kb
- Protein
- 395 aminosyror
- Tidigare symboler
- CBWD5
- MANE Select-transkript
- ENST00000382405.8NM_001330668.2
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/zng1e.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs ZNG1E, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser ZNG1E ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är ZNG1E uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,7 kb av genens 58,1 kb, och 1 188 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av ZNG1E
69Hög
Hur svår ZNG1E är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av ZNG1Es exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.100 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.100 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.2,1 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.38 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). ZNG1E-genen: Zn regulated GTPase metalloprotein activator 1E. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/zng1e
Dante Labs. ZNG1E-genen: Zn regulated GTPase metalloprotein activator 1E [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/zng1e
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor