Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

TRPA1

transient receptor potential cation channel subfamily A member 1

Sammanfattning

Cytogenetisk position
8q21.11
Koordinater
Kromosom 8: 72 021 250–72 075 584 (GRCh38)
Exoner
27 exoner på 54,3 kb
Protein
1 119 aminosyror
Tidigare symboler
ANKTM1
MANE Select-transkript
ENST00000262209.5NM_007332.3
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser TRPA1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är TRPA1 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 8, med en parentes där TRPA1 finns. TRPA1 och 3 gener i närheten på kromosom 8, från 71 548 417 till 72 548 416.Kromosom 88q21.11p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.371,6 Mb71,8 Mb72 Mb72,2 Mb72,4 MbEYA1: 71 197 432–71 592 025, bakåt-strängEYA1MSC: 71 840 939–71 844 501, bakåt-strängMSCTRPA1: 72 021 250–72 075 584, bakåt-strängTRPA1KCNB2: 72 537 220–72 938 349, framåt-strängKCNB2Diagram över TRPA1: 27 exoner på bakåt-strängen av kromosom 8Exon 27: 72 021 250–72 023 116, 1 867 baserExon 26: 72 023 814–72 023 911, 98 baserExon 25: 72 025 960–72 026 073, 114 baserExon 24: 72 029 901–72 029 969, 69 baserExon 23: 72 033 644–72 033 826, 183 baserExon 22: 72 034 248–72 034 377, 130 baserExon 21: 72 036 288–72 036 457, 170 baserExon 20: 72 037 983–72 038 072, 90 baserExon 19: 72 038 865–72 039 027, 163 baserExon 18: 72 039 727–72 039 797, 71 baserExon 17: 72 046 513–72 046 608, 96 baserExon 16: 72 047 148–72 047 207, 60 baserExon 15: 72 050 778–72 050 871, 94 baserExon 14: 72 052 599–72 052 765, 167 baserExon 13: 72 053 753–72 053 867, 115 baserExon 12: 72 055 436–72 055 600, 165 baserExon 11: 72 055 686–72 055 855, 170 baserExon 10: 72 056 917–72 057 017, 101 baserExon 9: 72 057 717–72 057 816, 100 baserExon 8: 72 059 390–72 059 438, 49 baserExon 7: 72 061 625–72 061 761, 137 baserExon 6: 72 062 799–72 062 944, 146 baserExon 5: 72 063 463–72 063 571, 109 baserExon 4: 72 065 451–72 065 558, 108 baserExon 3: 72 069 023–72 069 198, 176 baserExon 2: 72 071 711–72 071 867, 157 baserExon 1: 72 075 299–72 075 584, 286 baser27262422201816141210864215′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 5,2 kb av genens 54,3 kb, och 3 360 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av TRPA1

10Lätt

Hur svår TRPA1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Nästan alla exoner i TRPA1 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.

Det som tillkommer: andelen av TRPA1s exoner i varje typ av svår region

  • Kartläggbarhet8 %
  • Homologi0 %
  • Delas med chrY0 %
  • Referenstäckning0 %
  • Repetitioner1,6 %
  • GC-innehåll10 %

Ett Dante Labs-poäng från egen forskning, baserat på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts det

Egenskaper kopplade till TRPA1

Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som TRPA1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). TRPA1-genen: transient receptor potential cation channel subfamily A member 1. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/trpa1

Vancouver

Dante Labs. TRPA1-genen: transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/trpa1

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test