Gen
SPATA31C1
SPATA31 subfamily C member 1
- HGNC 27846↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000230246↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 441452↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 9q22.1
- Koordinater
- Kromosom 9: 87 917 962–87 923 657 (GRCh38)
- Exoner
- 4 exoner på 5,7 kb
- Protein
- 1 188 aminosyror
- Även känd som
- FLJ36055
- Tidigare symboler
- FAM75C1
- MANE Select-transkript
- ENST00000706933.1NM_001145124.1
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/spata31c1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs SPATA31C1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser SPATA31C1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är SPATA31C1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3,8 kb av genens 5,7 kb, och 3 567 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av SPATA31C1
64Hög
Hur svår SPATA31C1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av SPATA31C1s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.95 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.100 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.2,7 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.2,1 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SPATA31C1-genen: SPATA31 subfamily C member 1. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/spata31c1
Dante Labs. SPATA31C1-genen: SPATA31 subfamily C member 1 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/spata31c1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor