Gen
RPS27A
ribosomal protein S27a
- HGNC 10417↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000143947↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 6233↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 2p16.1
- Koordinater
- Kromosom 2: 55 232 688–55 235 853 (GRCh38)
- Exoner
- 6 exoner på 3,2 kb
- Protein
- 156 aminosyror
- Även känd som
- UBCEP80, Uba80, S27A, eS31
- MANE Select-transkript
- ENST00000272317.11NM_002954.6
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rps27a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs RPS27A, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser RPS27A ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är RPS27A uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 0,8 kb av genens 3,2 kb, och 471 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av RPS27A
15Måttlig
Hur svår RPS27A är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Några av RPS27A:s exoner ligger där korta läsningar kan missa eller felplacera en förändring.
Det som adderar: andelen av RPS27A:s exoner i varje typ av svårt område
- MappbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 100 %.15 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Vikt 60 %.0 %
- ReferenstäckningLuckor i referensassemblyn i närheten, där det inte finns någon sekvens för läsningar att anpassas mot. Vikt 50 %.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, som läsningar glider på och som kanske inte spänner över. Vikt 30 %.0 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker tunnt. Vikt 20 %.0 %
En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängenVarje stapel är andelen av RPS27A:s exonbaser i just den typen av svårt område. Varje typ kan i sig göra en gen svår, och varje ytterligare typ adderar mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). RPS27A-genen: ribosomal protein S27a. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/rps27a
Dante Labs. RPS27A-genen: ribosomal protein S27a [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/rps27a
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor