Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

CASTOR1

cytosolic arginine sensor for mTORC1 subunit 1

Sammanfattning

Cytogenetisk position
22q12.2
Koordinater
Kromosom 22: 30 285 117–30 289 505 (GRCh38)
Exoner
9 exoner på 4,4 kb
Protein
329 aminosyror
Tidigare symboler
GATSL3
MANE Select-transkript
ENST00000407689.8NM_001037666.3
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser CASTOR1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är CASTOR1 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
Kromosom 22, med en parentes där CASTOR1 finns. CASTOR1 och 22 gener i närheten på kromosom 22, från 29 787 311 till 30 787 310.Kromosom 2222q12.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3329,8 Mb30 Mb30,2 Mb30,4 Mb30,6 MbASCC2: 29 788 044–29 838 304, bakåt-strängASCC2MTMR3: 29 883 141–30 030 868, framåt-strängMTMR3HORMAD2: 30 080 444–30 211 427, framåt-strängHORMAD2LIF: 30 240 453–30 246 804, bakåt-strängLIFOSM: 30 262 829–30 266 858, bakåt-strängOSMCASTOR1: 30 285 117–30 289 505, bakåt-strängCASTOR1: 30 285 238–30 299 482, bakåt-strängTBC1D10A: 30 291 990–30 326 947, bakåt-strängTBC1D10ASF3A1: 30 331 988–30 356 919, bakåt-strängSF3A1CCDC157: 30 356 631–30 378 673, framåt-strängCCDC157RNF215: 30 368 811–30 421 771, bakåt-strängRNF215SEC14L2: 30 396 941–30 425 303, framåt-strängSEC14L2: 30 409 255–30 428 990, framåt-strängMTFP1: 30 425 623–30 429 058, framåt-strängMTFP1SEC14L3: 30 447 959–30 472 056, bakåt-strängSEC14L4: 30 488 890–30 505 725, bakåt-strängSEC14L4SEC14L6: 30 522 799–30 546 741, bakåt-strängSEC14L6GAL3ST1: 30 554 632–30 576 210, bakåt-strängGAL3ST1PES1: 30 576 624–30 607 083, bakåt-strängPES1TCN2: 30 607 003–30 630 712, framåt-strängTCN2SLC35E4: 30 635 673–30 669 016, framåt-strängSLC35E4DUSP18: 30 652 051–30 667 887, bakåt-strängDUSP18OSBP2: 30 693 782–30 907 824, framåt-strängOSBP2Diagram över CASTOR1: 9 exoner på bakåt-strängen av kromosom 22Exon 9: 30 285 117–30 285 688, 572 baserExon 8: 30 285 832–30 285 926, 95 baserExon 7: 30 286 016–30 286 098, 83 baserExon 6: 30 286 263–30 286 376, 114 baserExon 5: 30 286 825–30 286 948, 124 baserExon 4: 30 287 155–30 287 287, 133 baserExon 3: 30 287 373–30 287 560, 188 baserExon 2: 30 288 706–30 288 776, 71 baserExon 1: 30 289 385–30 289 505, 121 baser9876543215′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 1,5 kb av genens 4,4 kb, och 990 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av CASTOR1

12Lätt

Hur svår CASTOR1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Nästan alla exoner i CASTOR1 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.

Det som adderar: andelen av CASTOR1:s exoner i varje typ av svårt område

  • Mappbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenstäckning0 %
  • Repetitioner1,4 %
  • GC-innehåll58 %

En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängen

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). CASTOR1-genen: cytosolic arginine sensor for mTORC1 subunit 1. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/castor1

Vancouver

Dante Labs. CASTOR1-genen: cytosolic arginine sensor for mTORC1 subunit 1 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/castor1

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test