Gen
AP3S1
adaptor related protein complex 3 subunit sigma 1
- HGNC 2013↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000177879↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 1176↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 5q22.3-q23.1
- Koordinater
- Kromosom 5: 115 841 935–115 914 081 (GRCh38)
- Exoner
- 6 exoner på 72,1 kb
- Protein
- 193 aminosyror
- Tidigare symboler
- CLAPS3
- MANE Select-transkript
- ENST00000316788.12NM_001284.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ap3s1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs AP3S1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser AP3S1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är AP3S1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,3 kb av genens 72,1 kb, och 582 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av AP3S1
9Låg
Hur svår AP3S1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av AP3S1s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.20 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.3,5 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.19 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). AP3S1-genen: adaptor related protein complex 3 subunit sigma 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/ap3s1
Dante Labs. AP3S1-genen: adaptor related protein complex 3 subunit sigma 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/ap3s1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor