Treceți la conținut
Folosiți fondurile HSA sau FSA
Secvențiați-vă genomul (se deschide într-un filă nouă)

Genă

SAMSN1

SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1

Rezumat

Localizare citogenetică
21q11.2
Coordonate
Cromozomul 21: 14.485.228–14.546.315 (GRCh38)
Exoni
8 de exoni pe 61,1 kb
Proteină
373 de aminoacizi
Denumiri alternative
NASH1, SASH2, SH3D6B, HACS1, SLy2
Transcriptul MANE Select
ENST00000400566.6NM_022136.5
Tip de locus
Care codifică proteine
  • Foarte ridicată
  • Ridicată
  • Scăzută
  • Foarte scăzută

Rapoarte curatoriate relevante pentru această genă

Niciun raport Genome Test nu citește încă SAMSN1. Testul secvențiază întregul dumneavoastră genom, deci datele dumneavoastră includ totuși și această genă.

Structura genei SAMSN1

  • Secvență codificatoare
  • Regiune netranslată
  • Intron
  • Sensul transcripției
  • Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Cromozomul 21, cu o paranteză în locul unde se află SAMSN1. SAMSN1 și încă 4 de gene în apropiere, pe cromozomul 21, între 14.015.772 și 15.015.771.Cromozomul 2121q11.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q21.1q21.2q21.3q22.11q22.12q22.13q22.2q22.314,2 Mb14,4 Mb14,6 Mb14,8 Mb15 MbLIPI: 14.108.813–14.210.955, catena inversăLIPIRBM11: 14.216.112–14.228.372, catena directăRBM11HSPA13: 14.368.767–14.383.484, catena inversăHSPA13SAMSN1: 14.485.228–14.546.315, catena inversăSAMSN1NRIP1: 14.961.235–15.065.936, catena inversăNRIP1Diagrama genei SAMSN1: 8 exoni pe catena inversă a cromozomului 21Exon 8: 14.485.228–14.486.114, 887 de bazeExon 7: 14.498.442–14.498.592, 151 de bazeExon 6: 14.500.529–14.500.735, 207 de bazeExon 5: 14.510.310–14.510.461, 152 de bazeExon 4: 14.512.444–14.512.573, 130 de bazeExon 3: 14.516.892–14.517.041, 150 de bazeExon 2: 14.521.150–14.521.221, 72 de bazeExon 1: 14.546.205–14.546.315, 111 de baze876543215′3′

Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.

Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).

Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.

Exonii reprezintă 1,9 kb din cei 61,1 kb ai genei; 1.122 dintre aceste baze codifică proteina.

Secvențiere SAMSN1

1Ușor

Cât de greu este de secvențiat SAMSN1 cu citiri scurte, din 100

Aproape toți exonii lui SAMSN1 se află în zone în care citirile scurte se aliniază curat.

Ce adaugă: ponderea exonilor lui SAMSN1 din fiecare tip de regiune dificilă

  • Mapabilitate0 %
  • Omologie0 %
  • Repetiții0,9 %
  • Conținut GC13 %
  • Acoperire de referință0 %

Un scor Dante Labs din propriile noastre cercetări, construit pe hărțile regiunilor greu de secvențiat Genome in a Bottle ale NIST.Cum se calculează scorul

Legături externe

De unde provin aceste date

  • HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
  • MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
  • Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.

Citează această pagină

APA

Dante Labs. (s.a.). Gena SAMSN1: SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1. Accesat 19 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/samsn1

Vancouver

Dante Labs. Gena SAMSN1: SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals 1 [Internet]. [citat 19 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/samsn1

Un test. Răspunsuri pentru o viață.

De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni

Comandați Genome Test-ul meu