Gena PMS2 — Sindromul Lynch cauzat de gena PMS2 prezintă o penetranță a cancerului mai scăzută decât în cazul genelor MLH1 sau MSH2, însă pseudogenul PMS2CL face ca testele genetice standard să fie nesigure, iar secvențierea genomului complet (WGS) oferă o evaluare mai precisă.
Secvențierea întregului genom permite evaluarea genei PMS2 cu o precizie mai mare decât testele de tip panel, prin analizarea regiunii complexe a pseudogenelor PMS2/PMS2CL — distingând variantele cu adevărat patogene de secvențele pseudogenelor.
Gena PMS2 — Sindromul Lynch
PMS2 (cromozomul 7p22.1) codifică o proteină implicată în repararea nepotrivirilor de ADN. Variantele patogene ale PMS2 cauzează sindromul Lynch cu o penetranță mai scăzută decât MLH1/MSH2 — aproximativ 15-20% risc de CCR pe durata vieții și 15% risc de cancer endometrial (față de 50-80% CCR pentru MLH1/MSH2). În ciuda penetranței mai scăzute, PMS2-Lynch conferă totuși un risc de cancer semnificativ din punct de vedere clinic, care necesită o supraveghere sporită.
PMS2 prezintă o provocare unică în ceea ce privește testarea — pseudogenul PMS2CL are o identitate de secvență de peste 98% cu exonii 1-5 ai genei PMS2, ceea ce duce la atribuirea eronată a variantelor în cadrul panourilor standard de secvențiere de nouă generație. Variantele din pseudogen pot fi identificate în mod eronat ca variante patogene ale genei PMS2 (rezultate fals pozitive), sau variantele reale ale genei PMS2 pot fi ignorate ca artefacte ale pseudogenului (rezultate fals negative). PCR-ul de lungă distanță, amplificarea specifică genelor sau abordările la nivel de genom complet îmbunătățesc acuratețea.
Managementul sindromului PMS2-Lynch include efectuarea unei colonoscopii la fiecare 1-2 ani începând cu vârsta de 25-30 de ani (mai târziu decât în cazul sindromului MLH1/MSH2, datorită penetranței mai scăzute), supravegherea cancerului endometrial la femeile purtătoare și luarea în considerare a chimioprevenției cu aspirină. Imunoterapia pentru cancerele cu deficit de PMS2 este extrem de eficientă — tumorile cu MSI ridicat/dMMR răspund spectaculos la pembrolizumab, indiferent de gena MMR care prezintă deficit.
Pseudogenul PMS2, denumit PMS2CL, complică testarea genetică standard. Variantele sunt adesea clasificate eronat. Dacă ați obținut rezultate „VUS” sau „patogene” pentru PMS2 în urma testării prin panel, se recomandă confirmarea prin secvențierea întregului genom (WGS).
PMS2 este cea mai dificilă genă Lynch de testat cu precizie, din cauza pseudogenului său. Secvențierea genomului complet (WGS) oferă o evaluare superioară prin citirea contextului genomic integral, reducând astfel rezultatele fals pozitive și fals negative cauzate de interferența pseudogenului.
Interferența pseudogenelor generează rezultate fals pozitive și fals negative pentru PMS2 — secvențierea întregului genom (WGS) elimină această ambiguitate
Panourile NGS standard atribuie adesea în mod eronat variantele între genele PMS2 și PMS2CL. Un pacient căruia i s-a spus că are o variantă patogenă a genei PMS2 poate avea, de fapt, o variantă benignă a pseudogenului (rezultat fals pozitiv → monitorizare inutilă). În schimb, o variantă reală a genei PMS2 poate fi interpretată ca zgomot al pseudogenului (rezultat fals negativ → diagnostic Lynch ratat). Secvențierea genomului complet (WGS) analizează contextul genomic integral, îmbunătățind precizia atribuirii variantelor.
Cancerele PMS2-Lynch răspund la imunoterapie — statutul dMMR permite utilizarea pembrolizumabului, indiferent de gena MMR specifică
Tumorile cu deficit de PMS2 prezintă un profil MSI ridicat și răspund la inhibitorii punctelor de control imunitare. Pembrolizumabul este aprobat de FDA pentru toate tipurile de cancer cu profil MSI ridicat/dMMR, indiferent de țesutul de origine. Confirmarea statutului germinal al genei PMS2 identifică mecanismul molecular care stă la baza profilului MSI ridicat și declanșează efectuarea unor teste în cascadă la nivelul familiei.
Întregul tău ADN (nu doar o parte din el)
Testele genetice tradiționale analizează seturi restrânse de gene, omițând cea mai mare parte a genomului dumneavoastră. Noi secvențiem întregul dumneavoastră genom — fiecare genă și fiecare regiune dintre gene.
Analize detaliate și rapoarte specializate
Ușor de citit și cu răspunsuri pe baza cărora dumneavoastră și medicul dumneavoastră puteți lua măsuri. Nu este un dosar care trebuie interpretat — peste 200 de rapoarte clinice, organizate pe categorii.
Testul dumneavoastră capătă o valoare tot mai mare cu fiecare an
ADN-ul dumneavoastră nu se schimbă, dar știința genomului avansează cu pași rapizi. În fiecare lună, se descoperă noi asocieri între variante și boli. Noi validăm aceste descoperiri și vă actualizăm automat rapoartele. Testul dumneavoastră devine din ce în ce mai valoros pe măsură ce trec anii.
Rezultatele pe care medicii le obțin în cele mai dificile cazuri.
Patruzeci de ani de incertitudine. Un singur test.
Un pacient a petrecut zeci de ani în sistemul de sănătate din Marea Britanie fără a primi un diagnostic. Datele furnizate de Dante, acceptate de echipele clinice ale NHS de la Spitalul Universitar Queen Elizabeth din Glasgow, au identificat sindromul Noonan și o variantă a genei RUNX1 asociată cu leucemia, care rămăsese nedetectată. După 40 de ani, aceștia au primit în sfârșit un răspuns.
O lectură completă oferă o imagine completă.
Un pacient s-a prezentat la Dante pentru a investiga o paralizie periodică. Analiza genomului complet a identificat o afecțiune cardiacă ereditară asociată — sindromul Brugada — pe care medicul său a confirmat-o printr-un ECG. Rezultatul a oferit, de asemenea, o explicație pentru antecedentele cardiace nedeslușite ale unui membru al familiei. Un singur test. Toate răspunsurile într-un singur test.
Secvențiat în 2019. Datele au fost prelucrate în 2021.
Jennifer și-a secvențiat genomul cu ajutorul aplicației Dante cu doi ani înainte de a fi diagnosticată cu cancer de sân. Când a început tratamentul, datele farmacogenomice furnizate de Dante au arătat că chimioterapia care i-a fost prescrisă ar fi putut provoca efecte adverse grave. Medicul ei a ales o alternativă, iar ea a început un tratament eficient încă din prima zi.
Fiecare întrebare legată de genetică merită un răspuns complet.
Fie că ești în căutarea unor răspunsuri astăzi sau că vrei să-ți protejezi sănătatea pentru viitor, o secvențiere completă a întregului tău genom este singurul punct de plecare.
E o trăsătură de familie. Acum poți afla dacă este și în genele tale.
Genomul dumneavoastră conține variante moștenite asociate cu afecțiuni medicale precum cele cardiace, canceroase și neurologice. Le analizăm pe toate — cu o abordare clinică aprofundată, pentru a conferi semnificație rezultatelor.
Află mai multe →Când analizele de laborator obișnuite arată că ești sănătos. Dar tu știi că nu e așa.
Testele de diagnostic standard verifică un set prestabilit de răspunsuri. Noi secvențiem întregul tău ADN — inclusiv părțile pe care niciun test nu a fost conceput să le verifice. Dacă răspunsul se află în genomul tău, te vom ajuta să-l găsești.
Află mai multe →Este posibil ca diagnosticul dumneavoastră să fie corect. Este posibil ca planul dumneavoastră de tratament să fie incomplet.
Genele dumneavoastră determină care tratamente au cele mai mari șanse de succes — și care nu. Noi îi oferim medicului dumneavoastră instrumentele și informațiile necesare pentru a vă stabili planul de tratament.
Află mai multe →Vrei să afli înainte ca ceva să te oblige să pui întrebarea.
Unii oameni nu așteaptă un diagnostic sau antecedente familiale pentru a lua măsuri. Secvențierea întregului genom vă oferă o imagine genetică completă chiar acum — astfel încât dumneavoastră și medicul dumneavoastră să puteți lua decizii în cunoștință de cauză înainte ca situația să devină urgentă.
Află mai multe →Ai făcut deja un test ADN. Iată ce nu ți-a putut dezvălui.
Majoritatea testelor ADN destinate consumatorilor analizează mai puțin de 0,1% din genomul dumneavoastră. Noi îl analizăm în întregime.
Află mai multe →Rezultate de nivel clinic. Alegerea persoanelor fizice, recomandate de medici pentru cele mai complexe cazuri.
Testul Dante Genome a ajutat specialiștii dintr-un spital național de urgență din Marea Britanie să identifice sindromul Noonan și o variantă genetică rară asociată cu leucemia, care rămăsese nedetectată. Acest rezultat a schimbat modul de îngrijire medicală a pacientului.
Acreditat de și publicat în
Întrebări frecvente despre secvențierea întregului genom.
Care este diferența dintre secvențierea întregului genom și un test genetic țintit?
Testele genetice țintite — inclusiv panelurile standard pentru cancerul ereditar — analizează o listă prestabilită de variante cunoscute într-un set specific de gene. Acestea sunt concepute pentru a identifica ceea ce se știe deja că trebuie căutat. Secvențierea întregului genom analizează întregul genom: toate cele 6 miliarde de perechi de baze, fiecare genă, fiecare regiune dintre gene. Un studiu al Mayo Clinic publicat în JAMA Oncology a constatat că ghidurile de testare standard au omis mai mult de jumătate dintre pacienții cu mutații canceroase ereditare. Testul genomic nu are o listă fixă.
Ce voi primi când vor fi gata rezultatele?
Dante Genome vă oferă peste 200 de rapoarte gata de utilizare de către medici, organizate pe categorii clinice — cancer ereditar, afecțiuni cardiace, boli rare, farmacogenomică, statut de purtător și multe altele. Rapoartele sunt transmise în contul dvs. securizat Genome Manager și sunt formatate pentru utilizare clinică directă. Datele dvs. genomice sunt păstrate permanent și reanalizate automat pe măsură ce știința avansează.
Ce se întâmplă dacă se identifică o variantă semnificativă din punct de vedere clinic?
În cazul în care se identifică o variantă patogenă sau potențial patogenă, aceasta va fi marcată în mod clar în raportul destinat medicului, împreună cu contextul clinic, dovezile științifice publicate și pașii următori recomandați. Vă recomandăm să comunicați orice constatare semnificativă din punct de vedere clinic medicului dumneavoastră sau unui consilier genetic, care vă poate oferi îndrumare în ceea ce privește monitorizarea, reducerea riscului sau testarea în cascadă a membrilor familiei.
În ce fel diferă acest lucru de un test ADN destinat consumatorilor, precum 23andMe sau AncestryDNA?
Testele ADN destinate consumatorilor utilizează cipuri de genotipare care analizează mai puțin de 0,1% din genomul dumneavoastră — un set foarte restrâns de variante comune, preselectate. Acestea sunt optimizate pentru determinarea ascendenței și a trăsăturilor la nivel de populație, nu pentru descoperiri genetice clinice. Testul Dante Genome secvențiază 100% din genomul dumneavoastră la o acoperire de 30X, același standard utilizat în contextul diagnosticării clinice. Cele două teste nu sunt comparabile în ceea ce privește domeniul de aplicare, metodologia sau utilitatea clinică.
Cât durează până se observă rezultatele și cum sunt comunicate acestea?
Trusa de recoltare este expediată în termen de 48 de ore de la plasarea comenzii. Odată ce proba ajunge la laboratorul nostru certificat CLIA, secvențierea și analiza durează între 6 și 8 săptămâni. Rezultatele sunt transmise în siguranță către contul tău Genome Manager, unde poți accesa rapoartele, le poți partaja cu medicul tău și poți primi actualizări automate pe măsură ce noile descoperiri sunt validate în raport cu genomul tău.
Colaborăm cu organizații de susținere a pacienților din întreaga lume.
Dante Labs colaborează cu grupuri de susținere a pacienților de orice dimensiune — pentru sindromul Lynch (gena PMS2) și alte afecțiuni, rare sau frecvente. Oferim sprijin grupurilor din orice țară, inclusiv grupurilor virtuale de susținere a pacienților.
Vă putem oferi rapoarte personalizate, reduceri de grup și pachete adaptate nevoilor membrilor dumneavoastră. Vă rugăm să ne contactați prin intermediul formularului, iar noi vă vom răspunde în termen de două zile lucrătoare.
- Rapoarte genomice personalizate pentru membrii dumneavoastră
- Reduceri de grup și pachete personalizate
- Orice țară — inclusiv grupurile virtuale
- Afecțiuni rare și frecvente incluse
Am primit mesajul.
Vă vom contacta în termen de 2 zile lucrătoare. Pentru a ne contacta direct: hello@dantelabs.com
Un singur test.
O viață întreagă de răspunsuri.
Un singur kit, livrat la domiciliu. Secvențierea întregului genom conform standardelor clinice utilizate în luarea deciziilor diagnostice. Peste 200 de rapoarte gata de utilizare de către medici, livrate în contul dvs. Genome Manager în 6–8 săptămâni — permanente și actualizate pe măsură ce știința avansează.
Expediere în 48 de ore · Rezultate în 6–8 săptămâni
