Gen
MLLT6
MLLT6, PHD finger containing
- HGNC 7138↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000275023↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 4302↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 17q12
- Współrzędne
- Chromosom 17: 38 705 273–38 729 795 (GRCh38)
- Eksony
- 20 eksonów na odcinku 24,5 kb
- Białko
- 1093 aminokwasów
- Znany również jako
- AF17, FLJ23480
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000621332.5NM_005937.4
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/mllt6.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj MLLT6 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu MLLT6. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.
Budowa genu MLLT6
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 7,8 kb z 24,5 kb genu; 3282 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie MLLT6
18Umiarkowany
Stopień trudności sekwencjonowania genu MLLT6 krótkimi odczytami w skali 0–100
0 · Łatwy100 · Trudny
Niektóre eksony genu MLLT6 znajdują się w miejscach, gdzie krótkie odczyty mogą przeoczyć zmianę lub przypisać ją błędnie.
Co dokłada się do wyniku: udział eksonów genu MLLT6 w każdym rodzaju trudnego regionu
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się umieścić jednoznacznie, więc wywołanie wariantu może tam brakować lub być błędne. Waga 35%.16%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych częściach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub większej. Waga 30%.23%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować w całości. Waga 15%.13%
- Zawartość GCOkna z mniej niż 25% lub więcej niż 65% zawartości G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Waga 10%.30%
- Pokrycie referencjiLuki w pobliskim składzie sekwencji referencyjnej, gdzie nie ma sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Waga 10%.0%
Wynik Dante Labs z własnych badań, oparty na mapach trudno sekwencjonowalnych regionów NIST Genome in a Bottle.Jak liczymy wynikKażdy słupek to udział zasad eksonów genu MLLT6 w danym rodzaju trudnego regionu. Każdy rodzaj może sam w sobie uczynić gen trudnym, a każdy kolejny dodaje coraz mniej: 0, gdy żadna zasada nie leży w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się tam, gdzie odczytów nie da się umieścić jednoznacznie.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen MLLT6: MLLT6, PHD finger containing. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/mllt6
Dante Labs. Gen MLLT6: MLLT6, PHD finger containing [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/mllt6
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni