Gen
MAN2A1
mannosidase alpha class 2A member 1
- HGNC 6824↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000112893↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 4124↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 5q21.3
- Współrzędne
- Chromosom 5: 109 689 927–109 869 625 (GRCh38)
- Eksony
- 22 eksonów na odcinku 179,7 kb
- Białko
- 1144 aminokwasów
- Znany również jako
- GOLIM7, MANII
- Poprzednie symbole
- MANA2
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000261483.5NM_002372.4
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/man2a1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj MAN2A1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu MAN2A1. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.
Budowa genu MAN2A1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 6,6 kb z 179,7 kb genu; 3435 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie MAN2A1
2Łatwo
Jak trudno sekwencjonować MAN2A1 krótkimi odczytami, w skali 0–100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of MAN2A1's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of MAN2A1's exons in each kind of hard region
- MapowalnośćOdcinki, na których odczyty 100 lub 250 bp nie mogą być jednoznacznie umieszczone, więc wywołanie wariantu może tam brakować lub być błędne. Waga 35%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, na przykład paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub większej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i mogą ich nie obejmować. Waga 15%.3,3%
- Zawartość GCOkna z mniej niż 25% lub więcej niż 65% G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Waga 10%.11%
- Pokrycie referencjiLuki w pobliskim zestawie referencyjnym, gdzie brak sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Waga 10%.0%
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredKażdy słupek to udział zasad eksonów MAN2A1 w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je według tego, jak bardzo każda zasada utrudnia wywołanie krótkim odczytem: 0, gdy żadna zasada nie leży w żadnym regionie, 100, gdy każda zasada leży we wszystkich.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen MAN2A1: mannosidase alpha class 2A member 1. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/man2a1
Dante Labs. Gen MAN2A1: mannosidase alpha class 2A member 1 [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/man2a1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni