Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

GABARAPL1

GABA type A receptor associated protein like 1

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
12p13.2
Koordinater
Kromosom 12: 10 212 877–10 223 128 (GRCh38)
Eksoner
4 eksoner over 10,3 kb
Protein
117 aminosyrer
Også kjent som
gec1, APG8L, ATG8L, ATG8B
MANE Select-transkripsjon
ENST00000266458.10NM_031412.4
Lokustype
Proteinkodende
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser GABARAPL1 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er GABARAPL1 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 12, med en parentes der GABARAPL1 står. GABARAPL1 og 26 gener i nærheten på kromosom 12, fra 9 718 003 til 10 718 002.Kromosom 1212p13.2p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.339,8 Mb10 Mb10,2 Mb10,4 Mb10,6 MbCLECL1: 9 702 182–9 740 383, bakover-strengCLECL1CD69: 9 752 486–9 760 901, bakover-strengCD69KLRF1: 9 827 420–9 845 007, fremover-strengKLRF1CLEC2B: 9 852 369–9 870 635, bakover-strengCLEC2BKLRF2: 9 881 489–9 895 833, fremover-strengKLRF2CLEC2A: 9 898 673–9 932 370, bakover-strengCLEC2ACLEC12A: 9 951 261–9 996 102, fremover-strengCLEC12ACLEC1B: 9 985 642–10 013 424, bakover-strengCLEC1BCLEC12B: 10 010 627–10 018 802, fremover-strengCLEC12BCLEC9A: 10 030 678–10 066 031, fremover-strengCLEC9ACLEC1A: 10 064 397–10 115 555, bakover-strengCLEC1ACLEC7A: 10 116 766–10 130 269, bakover-strengCLEC7AOLR1: 10 156 240–10 172 143, bakover-strengOLR1TMEM52B: 10 170 512–10 191 807, fremover-strengTMEM52BGABARAPL1: 10 212 877–10 223 128, fremover-strengGABARAPL1KLRD1: 10 226 058–10 329 608, fremover-strengKLRD1KLRK1: 10 371 338–10 391 874, bakover-strengKLRK1KLRC4-KLRK1: 10 372 353–10 410 146, bakover-strengKLRC4-KLRK1KLRC4: 10 403 058–10 409 757, bakover-strengKLRC4KLRC3: 10 412 309–10 420 595, bakover-strengKLRC3: 10 412 312–10 436 001, bakover-strengKLRC2: 10 426 854–10 442 300, bakover-strengKLRC1: 10 440 411–10 454 685, bakover-strengEIF2S3B: 10 505 602–10 523 135, fremover-strengEIF2S3BMAGOHB: 10 603 393–10 613 616, bakover-strengMAGOHBSTYK1: 10 616 641–10 674 318, bakover-strengSTYK1YBX3: 10 693 264–10 723 689, bakover-strengYBX3Diagram av GABARAPL1: 4 eksoner på fremover-strengen til kromosom 12Ekson 1: 10 212 877–10 213 219, 343 baserEkson 2: 10 218 063–10 218 141, 79 baserEkson 3: 10 220 440–10 220 558, 119 baserEkson 4: 10 221 787–10 223 128, 1 342 baser12345′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 1,9 kb av genets 10,3 kb, og 354 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av GABARAPL1

44Vanskelig

Hvor vanskelig GABARAPL1 er å sekvensere med korte leser, av 100

Mye av GABARAPL1 ligger der korte leser kan overse eller feilplassere en endring.

Det som kommer i tillegg: andelen av eksonene til GABARAPL1 i hver type vanskelig område

  • Kartleggbarhet0 %
  • Homologi70 %
  • Delt med chrY0 %
  • Referansedekning0 %
  • Repetisjoner1,1 %
  • GC-innhold18 %

En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummen

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). GABARAPL1-genet: GABA type A receptor associated protein like 1. Hentet 20. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/gabarapl1

Vancouver

Dante Labs. GABARAPL1-genet: GABA type A receptor associated protein like 1 [Internett]. [sitert 20. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/gabarapl1

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test