Ga naar de inhoud
Gebruik uw HSA- of FSA-tegoed
Laat uw genoom in kaart brengen (opent in een nieuw tabblad)

Gen

HOXA10

homeobox A10

Samenvatting

Cytogenetische locatie
7p15.2
Coördinaten
Chromosoom 7: 27.170.605–27.174.320 (GRCh38)
Exons
2 exons over 3,7 kb
Eiwit
410 aminozuren
Eerdere symbolen
HOX1H, HOX1
MANE Select-transcript
ENST00000283921.5NM_018951.4
Type locus
Eiwitcoderend
  • Zeer hoog
  • Betrouwbaar
  • Laag
  • Zeer laag

Gecureerde rapporten over dit gen

Geen enkel Genome Test-rapport leest HOXA10 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.

Opbouw van HOXA10

  • Coderende sequentie
  • Niet-vertaald gebied
  • Intron
  • Richting van transcriptie
  • Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Chromosoom 7, met een haakje waar HOXA10 zich bevindt. HOXA10 en 14 genen in de buurt op chromosoom 7, van 26.672.463 tot 27.672.462.Chromosoom 77p15.2p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.326,8 Mb27 Mb27,2 Mb27,4 Mb27,6 MbSKAP2: 26.667.003–26.995.239, omgekeerde-strengSKAP2HOXA1: 27.092.993–27.096.039, omgekeerde-strengHOXA1HOXA2: 27.099.978–27.102.686, omgekeerde-strengHOXA2HOXA3: 27.106.184–27.152.610, omgekeerde-strengHOXA4: 27.127.887–27.130.780, omgekeerde-strengHOXA5: 27.141.052–27.143.719, omgekeerde-strengHOXA6: 27.144.103–27.150.603, omgekeerde-strengHOXA7: 27.153.716–27.157.936, omgekeerde-strengHOXA10-HOXA9: 27.162.438–27.180.239, omgekeerde-strengHOXA10-HOXA9HOXA9: 27.162.438–27.175.180, omgekeerde-strengHOXA9HOXA10: 27.170.605–27.174.320, omgekeerde-strengHOXA10HOXA11: 27.181.157–27.185.253, omgekeerde-strengHOXA11HOXA13: 27.193.503–27.200.091, omgekeerde-strengEVX1: 27.242.700–27.250.493, voorwaartse-strengEVX1HIBADH: 27.486.365–27.663.013, omgekeerde-strengHIBADHDiagram van HOXA10: 2 exons op de omgekeerde streng van chromosoom 7Exon 2: 27.170.605–27.172.173, 1.569 basenExon 1: 27.173.349–27.174.320, 972 basen215′3′

Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.

Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).

Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.

Exonen vormen 2,5 kb van de 3,7 kb van het gen; 1.233 van die basen coderen voor het eiwit.

Sequencing HOXA10

19Gemiddeld

Hoe moeilijk HOXA10 is om met korte reads te sequencen, op een schaal van 100

Sommige exonen van HOXA10 liggen op plaatsen waar korte reads een wijziging kunnen missen of verkeerd plaatsen.

Wat er nog bij komt: het aandeel van de exonen van HOXA10 in elk soort moeilijke regio

  • Mappability6,2%
  • Homologie0%
  • Shared with chrY0%
  • Referentiedekking0%
  • Herhalingen15%
  • GC-gehalte47%

Een score van Dante Labs op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Hoe de score wordt berekend

Externe links

Waar dit vandaan komt

  • HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
  • MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
  • De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.

Deze pagina citeren

APA

Dante Labs. (z.d.). HOXA10-gen: homeobox A10. Geraadpleegd op 19 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/hoxa10

Vancouver

Dante Labs. HOXA10-gen: homeobox A10 [Internet]. [geraadpleegd 19 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/hoxa10

Eén test. Een leven lang antwoorden.

Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken

Mijn Genome Test bestellen