Ga naar de inhoud
Gebruik uw HSA- of FSA-tegoed
Laat uw genoom in kaart brengen (opent in een nieuw tabblad)

Gen

CHORDC1

cysteine and histidine rich domain containing 1

Samenvatting

Cytogenetische locatie
11q14.3
Coördinaten
Chromosoom 11: 90.200.429–90.223.049 (GRCh38)
Exons
11 exons over 22,6 kb
Eiwit
332 aminozuren
Ook bekend als
CHP1, CHP-1
MANE Select-transcript
ENST00000320585.11NM_012124.3
Type locus
Eiwitcoderend
  • Zeer hoog
  • Betrouwbaar
  • Laag
  • Zeer laag

Gecureerde rapporten over dit gen

Geen enkel Genome Test-rapport leest CHORDC1 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.

Opbouw van CHORDC1

  • Coderende sequentie
  • Niet-vertaald gebied
  • Intron
  • Richting van transcriptie
  • Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Chromosoom 11, met een haakje waar CHORDC1 zich bevindt. CHORDC1 en 9 genen in de buurt op chromosoom 11, van 89.711.739 tot 90.711.738.Chromosoom 1111q14.3p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2589,8 Mb90 Mb90,2 Mb90,4 Mb90,6 MbTRIM77: 89.710.299–89.717.872, voorwaartse-strengTRIM77TRIM49: 89.797.655–89.808.575, omgekeerde-strengTRIM49TRIM64B: 89.870.145–89.878.487, omgekeerde-strengTRIM64BTRIM49D1: 89.911.111–89.922.245, omgekeerde-strengTRIM49D1TRIM49D2: 89.924.064–89.933.063, voorwaartse-strengTRIM49D2TRIM64: 89.966.037–89.974.072, voorwaartse-strengTRIM64TRIM49C: 90.031.106–90.042.025, voorwaartse-strengTRIM49CUBTFL1: 90.085.950–90.087.131, voorwaartse-strengUBTFL1NAALAD2: 90.131.515–90.192.894, voorwaartse-strengNAALAD2CHORDC1: 90.200.429–90.223.049, omgekeerde-strengCHORDC1Diagram van CHORDC1: 11 exons op de omgekeerde streng van chromosoom 11Exon 11: 90.200.429–90.202.551, 2.123 basenExon 10: 90.202.813–90.202.875, 63 basenExon 9: 90.203.308–90.203.427, 120 basenExon 8: 90.205.460–90.205.565, 106 basenExon 7: 90.206.202–90.206.272, 71 basenExon 6: 90.210.536–90.210.594, 59 basenExon 5: 90.211.215–90.211.318, 104 basenExon 4: 90.214.018–90.214.175, 158 basenExon 3: 90.215.174–90.215.230, 57 basenExon 2: 90.218.135–90.218.184, 50 basenExon 1: 90.222.891–90.223.049, 159 basen11109876543215′3′

Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.

Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).

Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.

Exonen vormen 3,1 kb van de 22,6 kb van het gen; 999 van die basen coderen voor het eiwit.

Sequencing CHORDC1

55Moeilijk

Hoe moeilijk CHORDC1 is om met korte reads te sequencen, op een schaal van 100

Een groot deel van CHORDC1 ligt op plaatsen waar korte reads een wijziging kunnen missen of verkeerd plaatsen.

Wat er nog bij komt: het aandeel van de exonen van CHORDC1 in elk soort moeilijke regio

  • Mappability17%
  • Homologie75%
  • Shared with chrY0%
  • Referentiedekking0%
  • Herhalingen2,9%
  • GC-gehalte1,9%

Een score van Dante Labs op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Hoe de score wordt berekend

Externe links

Waar dit vandaan komt

  • HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
  • MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
  • De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.

Deze pagina citeren

APA

Dante Labs. (z.d.). CHORDC1-gen: cysteine and histidine rich domain containing 1. Geraadpleegd op 19 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/chordc1

Vancouver

Dante Labs. CHORDC1-gen: cysteine and histidine rich domain containing 1 [Internet]. [geraadpleegd 19 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/chordc1

Eén test. Een leven lang antwoorden.

Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken

Mijn Genome Test bestellen