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Gene

USO1

USO1 vesicle transport factor

Sintesi

Localizzazione citogenetica
4q21.1
Coordinate
Cromosoma 4: 75.724.577–75.814.286 (GRCh38)
Esoni
24 esoni su 89,7 kb
Proteina
962 amminoacidi
Noto anche come
TAP, VDP, p115
Trascritto MANE Select
ENST00000514213.7NM_003715.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora USO1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di USO1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 4, con una parentesi dove si trova USO1. USO1 e 16 geni nelle vicinanze sul cromosoma 4, da 75.269.432 a 76.269.431.Cromosoma 44q21.1p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.275,4 Mb75,6 Mb75,8 Mb76 Mb76,2 MbRCHY1: 75.479.033–75.514.764, filamento inversoRCHY1THAP6: 75.513.946–75.550.473, filamento direttoTHAP6ODAPH: 75.556.028–75.565.997, filamento direttoODAPHCDKL2: 75.576.494–75.630.716, filamento inversoCDKL2G3BP2: 75.641.849–75.726.301, filamento inversoG3BP2USO1: 75.724.577–75.814.286, filamento direttoUSO1PPEF2: 75.859.864–75.902.571, filamento inversoPPEF2NAAA: 75.910.655–75.941.118, filamento inversoNAAASDAD1: 75.940.950–75.990.962, filamento inversoSDAD1CXCL9: 76.001.275–76.007.515, filamento inversoCXCL9ART3: 76.011.176–76.114.094, filamento direttoART3CXCL10: 76.021.118–76.023.518, filamento inversoCXCL10CXCL11: 76.033.682–76.050.206, filamento inversoCXCL11NUP54: 76.107.562–76.148.509, filamento inversoNUP54SCARB2: 76.158.723–76.234.536, filamento inversoSCARB2FAM47E: 76.214.040–76.284.296, filamento direttoFAM47EFAM47E-STBD1: 76.251.721–76.311.129, filamento direttoFAM47E-STBD1Diagramma di USO1: 24 esoni sul filamento diretto del cromosoma 4Esone 1: 75.724.577–75.724.885, 309 basiEsone 2: 75.752.373–75.752.459, 87 basiEsone 3: 75.752.540–75.752.604, 65 basiEsone 4: 75.757.497–75.757.573, 77 basiEsone 5: 75.770.439–75.770.539, 101 basiEsone 6: 75.770.822–75.770.924, 103 basiEsone 7: 75.771.082–75.771.137, 56 basiEsone 8: 75.774.676–75.774.796, 121 basiEsone 9: 75.782.680–75.782.858, 179 basiEsone 10: 75.787.062–75.787.202, 141 basiEsone 11: 75.790.150–75.790.238, 89 basiEsone 12: 75.790.643–75.790.797, 155 basiEsone 13: 75.793.690–75.793.901, 212 basiEsone 14: 75.799.622–75.799.732, 111 basiEsone 15: 75.800.351–75.800.469, 119 basiEsone 16: 75.800.618–75.800.799, 182 basiEsone 17: 75.801.079–75.801.200, 122 basiEsone 18: 75.804.134–75.804.272, 139 basiEsone 19: 75.805.140–75.805.303, 164 basiEsone 20: 75.806.486–75.806.572, 87 basiEsone 21: 75.808.953–75.809.051, 99 basiEsone 22: 75.810.432–75.810.539, 108 basiEsone 23: 75.812.160–75.812.375, 216 basiEsone 24: 75.813.206–75.814.286, 1081 basi15101520245′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4,1 kb dei 89,7 kb del gene; 2889 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene USO1: USO1 vesicle transport factor. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/uso1

Vancouver

Dante Labs. Gene USO1: USO1 vesicle transport factor [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/uso1

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