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Gene

TOPBP1

DNA topoisomerase II binding protein 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
3q22.1
Coordinate
Cromosoma 3: 133.600.238–133.661.941 (GRCh38)
Esoni
28 esoni su 61,7 kb
Proteina
1522 amminoacidi
Noto anche come
KIAA0259, TOP2BP1, Dpb11
Trascritto MANE Select
ENST00000260810.10NM_007027.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora TOPBP1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di TOPBP1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 3, con una parentesi dove si trova TOPBP1. TOPBP1 e 8 geni nelle vicinanze sul cromosoma 3, da 133.131.090 a 134.131.089.Cromosoma 33q22.1p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29133,2 Mb133,4 Mb133,6 Mb133,8 Mb134 MbTMEM108: 133.038.276–133.397.775, filamento direttoTMEM108BFSP2: 133.400.056–133.475.222, filamento direttoBFSP2CDV3: 133.573.543–133.590.274, filamento direttoCDV3TOPBP1: 133.600.238–133.661.941, filamento inversoTOPBP1TF: 133.745.862–133.796.641, filamento direttoTFSRPRB: 133.784.023–133.825.772, filamento direttoSRPRBRAB6B: 133.819.939–133.895.889, filamento inversoRAB6BSLCO2A1: 133.930.258–134.052.184, filamento inversoSLCO2A1RYK: 134.065.303–134.250.929, filamento inversoRYKDiagramma di TOPBP1: 28 esoni sul filamento inverso del cromosoma 3Esone 28: 133.600.238–133.601.393, 1156 basiEsone 27: 133.608.535–133.608.696, 162 basiEsone 26: 133.608.873–133.608.962, 90 basiEsone 25: 133.611.004–133.611.141, 138 basiEsone 24: 133.612.389–133.612.552, 164 basiEsone 23: 133.616.814–133.616.925, 112 basiEsone 22: 133.617.160–133.617.326, 167 basiEsone 21: 133.618.213–133.618.433, 221 basiEsone 20: 133.620.155–133.620.347, 193 basiEsone 19: 133.623.091–133.623.193, 103 basiEsone 18: 133.623.311–133.623.457, 147 basiEsone 17: 133.624.052–133.624.175, 124 basiEsone 16: 133.628.362–133.628.471, 110 basiEsone 15: 133.628.560–133.628.733, 174 basiEsone 14: 133.637.876–133.638.162, 287 basiEsone 13: 133.639.959–133.640.170, 212 basiEsone 12: 133.643.200–133.643.372, 173 basiEsone 11: 133.644.020–133.644.363, 344 basiEsone 10: 133.649.383–133.649.633, 251 basiEsone 9: 133.649.780–133.649.943, 164 basiEsone 8: 133.652.463–133.652.629, 167 basiEsone 7: 133.653.345–133.653.524, 180 basiEsone 6: 133.655.290–133.655.486, 197 basiEsone 5: 133.656.676–133.656.857, 182 basiEsone 4: 133.657.798–133.657.941, 144 basiEsone 3: 133.659.016–133.659.150, 135 basiEsone 2: 133.661.044–133.661.134, 91 basiEsone 1: 133.661.769–133.661.941, 173 basi2825201510515′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 5,8 kb dei 61,7 kb del gene; 4569 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene TOPBP1: DNA topoisomerase II binding protein 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/topbp1

Vancouver

Dante Labs. Gene TOPBP1: DNA topoisomerase II binding protein 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/topbp1

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